291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5778 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  100 
 
 
815 aa  1605    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  43.12 
 
 
827 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  35.51 
 
 
743 aa  283  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  30.61 
 
 
812 aa  211  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  30.22 
 
 
850 aa  208  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  31.48 
 
 
762 aa  193  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  29.04 
 
 
800 aa  191  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  31.56 
 
 
810 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  33.12 
 
 
818 aa  179  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  29.36 
 
 
831 aa  176  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  29.76 
 
 
788 aa  171  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  27.27 
 
 
794 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  31.14 
 
 
822 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  27.09 
 
 
846 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  29.65 
 
 
798 aa  159  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  26.21 
 
 
825 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  32.03 
 
 
763 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  27.87 
 
 
790 aa  146  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  26.91 
 
 
914 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  28.93 
 
 
725 aa  133  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  28.04 
 
 
771 aa  131  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  34.09 
 
 
820 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  43.97 
 
 
744 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
730 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  29.11 
 
 
749 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  33.83 
 
 
790 aa  112  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  36.93 
 
 
736 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  36.72 
 
 
890 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  36.42 
 
 
681 aa  105  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  34.92 
 
 
720 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  32.28 
 
 
783 aa  102  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  40.29 
 
 
806 aa  103  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  29.21 
 
 
742 aa  102  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  39.22 
 
 
742 aa  101  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  31.38 
 
 
862 aa  99.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  32.83 
 
 
760 aa  98.6  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  28.21 
 
 
742 aa  98.6  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  36.84 
 
 
728 aa  97.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  37.27 
 
 
730 aa  97.1  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  36.23 
 
 
730 aa  94.7  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  38.12 
 
 
737 aa  94.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0487  transglutaminase domain protein  29.57 
 
 
848 aa  92.8  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  36.11 
 
 
795 aa  92.8  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  35.42 
 
 
637 aa  92.4  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  31.61 
 
 
840 aa  90.9  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  28.95 
 
 
742 aa  90.5  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  32.93 
 
 
742 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3572  transglutaminase domain protein  36.92 
 
 
982 aa  90.1  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0384986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  30.06 
 
 
742 aa  90.1  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0636  transglutaminase domain-containing protein  37.21 
 
 
830 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00254265  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  30.06 
 
 
742 aa  90.1  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  29.07 
 
 
790 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  32.55 
 
 
774 aa  89  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  26.98 
 
 
742 aa  89  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  32.02 
 
 
753 aa  89  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  36.22 
 
 
689 aa  89  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  31.63 
 
 
815 aa  88.6  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  33.53 
 
 
769 aa  88.2  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  35.71 
 
 
859 aa  88.2  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  31.94 
 
 
886 aa  87.4  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  28.69 
 
 
790 aa  86.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  23.93 
 
 
742 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  31.14 
 
 
635 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  30.32 
 
 
667 aa  85.9  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  37.59 
 
 
709 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  36.05 
 
 
715 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  36.43 
 
 
763 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  32.37 
 
 
784 aa  85.1  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  35.92 
 
 
732 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  28.32 
 
 
676 aa  85.1  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  30.11 
 
 
667 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  34.01 
 
 
653 aa  84.7  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  34.12 
 
 
748 aa  84.7  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  30.59 
 
 
656 aa  84.7  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  34.78 
 
 
634 aa  84  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  36.36 
 
 
715 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  31.03 
 
 
641 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  36.36 
 
 
715 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4815  transglutaminase domain protein  27.15 
 
 
775 aa  83.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  27.36 
 
 
866 aa  82.8  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  38.4 
 
 
734 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  38.4 
 
 
734 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  38.4 
 
 
707 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  31.75 
 
 
691 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  32.57 
 
 
669 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  35.34 
 
 
668 aa  81.6  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1333  transglutaminase domain protein  25.71 
 
 
762 aa  81.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135993  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  28.45 
 
 
800 aa  81.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1293  transglutaminase domain protein  32.64 
 
 
803 aa  80.9  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269788  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  38.02 
 
 
739 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  38.02 
 
 
739 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  34.38 
 
 
674 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 
706 aa  80.1  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  34.81 
 
 
644 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  30.59 
 
 
826 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  32.37 
 
 
639 aa  79  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  31.53 
 
 
681 aa  79  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  33.59 
 
 
662 aa  78.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  30.22 
 
 
753 aa  78.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  28.17 
 
 
635 aa  78.2  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>