More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3361 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 515 aa  1022    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  59.01 
 
 		 484 aa  545  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  50.82 
 
 		 485 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  47.77 
 
 		 478 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  49.13 
 
 		 478 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  43.76 
 
 		 492 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  43.67 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0148  transglutaminase domain-containing protein  27.31 
 
 		 495 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  28.35 
 
 		 515 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  28.35 
 
 		 515 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4075  transglutaminase-like  28.42 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  28.95 
 
 		 510 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  33.8 
 
 		 1305 aa  79.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  36 
 
 		 523 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  31.58 
 
 		 528 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  36.27 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  36.27 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5617  transglutaminase domain protein  55.74 
 
 		 517 aa  70.5  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0710722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  27.31 
 
 		 274 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  26.89 
 
 		 274 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3562  transglutaminase domain protein  35.2 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3494  transglutaminase domain protein  35.2 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 634 aa  67.8  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  40.24 
 
 		 269 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  30.28 
 
 		 273 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  36.45 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  34.62 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  31.13 
 
 		 631 aa  65.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  34.92 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  32 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  31.88 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  28.62 
 
 		 292 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  28.72 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  40.91 
 
 		 264 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  37.36 
 
 		 266 aa  63.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  31.88 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  32.67 
 
 		 571 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  35.45 
 
 		 259 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  31.4 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  26.89 
 
 		 265 aa  62.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  28.68 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  32.14 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  37.66 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5163  transglutaminase domain protein  30.63 
 
 		 279 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  27.68 
 
 		 281 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  31.88 
 
 		 266 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  32.61 
 
 		 266 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  31.43 
 
 		 202 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  31.16 
 
 		 259 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  34.78 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3334  transglutaminase domain protein  30.6 
 
 		 1139 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387126  normal  0.0234354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  30.3 
 
 		 272 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  30.16 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  26.38 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  38.1 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  28.91 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1984  transglutaminase-like  29.03 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  35.23 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  24.14 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  25.97 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  27.5 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  32.85 
 
 		 300 aa  57  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  35.96 
 
 		 254 aa  57  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  32.09 
 
 		 272 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  32.09 
 
 		 272 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  32.09 
 
 		 272 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  29.92 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  33.1 
 
 		 275 aa  57  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  27.59 
 
 		 559 aa  56.6  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04320  transglutaminase domain protein  35.09 
 
 		 1118 aa  56.6  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  30.4 
 
 		 298 aa  56.6  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 275 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  30.94 
 
 		 280 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  31.3 
 
 		 345 aa  56.6  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  43.37 
 
 		 288 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  28.57 
 
 		 261 aa  56.6  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22850  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30.83 
 
 		 259 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1065  transglutaminase domain-containing protein  29.67 
 
 		 1121 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.417532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  32.99 
 
 		 308 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1051  transglutaminase-like  34.69 
 
 		 285 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.647734  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  24.89 
 
 		 327 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1814  transglutaminase domain protein  41.1 
 
 		 290 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070269  hitchhiker  0.00579618 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11451  transglutaminase-like superfamily protein  34.69 
 
 		 285 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  34.38 
 
 		 273 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11441  transglutaminase-like superfamily protein  34.69 
 
 		 285 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  33.04 
 
 		 366 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  33.04 
 
 		 361 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  28.74 
 
 		 271 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  33.04 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3591  transglutaminase domain protein  27.63 
 
 		 291 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2008  transglutaminase domain protein  41.1 
 
 		 290 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  28.79 
 
 		 293 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  31.3 
 
 		 350 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  31.3 
 
 		 340 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  31.13 
 
 		 265 aa  55.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  32.33 
 
 		 274 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  31.18 
 
 		 280 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  36.36 
 
 		 632 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  26.45 
 
 		 282 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>