More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3615 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  100 
 
 
485 aa  978    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  55.44 
 
 
492 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  44.35 
 
 
485 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  45.96 
 
 
484 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  43.23 
 
 
515 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  42.58 
 
 
478 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  43.79 
 
 
478 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0148  transglutaminase domain-containing protein  27.1 
 
 
495 aa  113  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  39.74 
 
 
515 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  39.07 
 
 
515 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4075  transglutaminase-like  27.25 
 
 
515 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  46.08 
 
 
510 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5617  transglutaminase domain protein  46.15 
 
 
517 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0710722 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  36.42 
 
 
634 aa  75.1  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  27.98 
 
 
528 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  31.88 
 
 
1305 aa  70.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  30.19 
 
 
571 aa  70.5  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  30.66 
 
 
523 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  34.03 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  33.33 
 
 
276 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3562  transglutaminase domain protein  29.63 
 
 
523 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3494  transglutaminase domain protein  29.63 
 
 
523 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  30.14 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  32.62 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  39.78 
 
 
273 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  34.13 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  34.13 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  37.5 
 
 
259 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  24.31 
 
 
266 aa  65.1  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 
259 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  32.87 
 
 
280 aa  63.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  31.69 
 
 
631 aa  63.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  31.62 
 
 
269 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  32.5 
 
 
281 aa  63.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  33.97 
 
 
275 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1556  transglutaminase domain-containing protein  26.37 
 
 
272 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  27.94 
 
 
795 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  36.73 
 
 
273 aa  61.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  30.83 
 
 
298 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  37.89 
 
 
264 aa  60.8  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  31.25 
 
 
280 aa  60.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  33.33 
 
 
263 aa  60.5  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  30.52 
 
 
274 aa  60.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  31.5 
 
 
216 aa  60.1  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  30.05 
 
 
273 aa  60.1  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  35.42 
 
 
274 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  27.75 
 
 
265 aa  59.7  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  30.95 
 
 
307 aa  59.7  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 
281 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  32.28 
 
 
286 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  34.78 
 
 
259 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
274 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  30.57 
 
 
326 aa  58.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  36.17 
 
 
265 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  29.27 
 
 
294 aa  57.4  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  34.04 
 
 
266 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  34.04 
 
 
266 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  39.58 
 
 
268 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  36 
 
 
263 aa  57.4  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  36.36 
 
 
265 aa  57.4  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  27.89 
 
 
279 aa  57  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  36.46 
 
 
316 aa  57  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  29.08 
 
 
280 aa  56.6  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  29.76 
 
 
274 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22850  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  35.63 
 
 
259 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  45.33 
 
 
282 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  31.52 
 
 
308 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  29.61 
 
 
281 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  37.11 
 
 
269 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  29.38 
 
 
293 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  30.61 
 
 
272 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  27.27 
 
 
266 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  37.11 
 
 
269 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  35.96 
 
 
265 aa  55.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 
259 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  35.42 
 
 
311 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  32.56 
 
 
337 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  27.75 
 
 
345 aa  55.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  34.38 
 
 
270 aa  55.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  34.38 
 
 
278 aa  55.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2317  transglutaminase domain protein  30.23 
 
 
316 aa  55.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.253333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  42.11 
 
 
689 aa  55.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  29.86 
 
 
644 aa  54.7  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  27.57 
 
 
305 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2603  transglutaminase domain-containing protein  39 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767969 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1984  transglutaminase-like  34.65 
 
 
291 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  35.05 
 
 
283 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  26.47 
 
 
366 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  27.57 
 
 
305 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  26.47 
 
 
367 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  27.57 
 
 
305 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  28.95 
 
 
292 aa  54.3  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  32.43 
 
 
296 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  26.43 
 
 
340 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  31.52 
 
 
330 aa  54.3  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  26.43 
 
 
350 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  32.43 
 
 
286 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  29.76 
 
 
359 aa  53.9  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  26.43 
 
 
340 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  29.8 
 
 
338 aa  53.5  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>