243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2537 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
337 aa  685    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  71.81 
 
 
338 aa  518  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  73.44 
 
 
336 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  74.06 
 
 
336 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  44.81 
 
 
392 aa  261  8e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  41.59 
 
 
362 aa  243  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  41.56 
 
 
379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  41.85 
 
 
379 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  41.85 
 
 
379 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  40.89 
 
 
379 aa  226  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  39.1 
 
 
380 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  39.1 
 
 
380 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  39.1 
 
 
380 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  37.65 
 
 
380 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 
359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  38.71 
 
 
361 aa  209  6e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  39.31 
 
 
369 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  35.24 
 
 
366 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  36.05 
 
 
369 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  37.59 
 
 
371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  34.97 
 
 
328 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  38.21 
 
 
383 aa  162  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
373 aa  155  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  34.73 
 
 
363 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  30.84 
 
 
432 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  29.82 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  29.47 
 
 
301 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  26.01 
 
 
310 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  26.9 
 
 
559 aa  95.1  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  29.35 
 
 
350 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  28.63 
 
 
500 aa  83.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  26.75 
 
 
631 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  33.85 
 
 
1305 aa  73.9  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  28.65 
 
 
634 aa  69.7  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  25.61 
 
 
507 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  30.77 
 
 
818 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  27.14 
 
 
571 aa  62.8  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  25.11 
 
 
467 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  29.67 
 
 
822 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  30.66 
 
 
762 aa  60.1  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  31.43 
 
 
914 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  32.03 
 
 
742 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  30.95 
 
 
862 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  46.27 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  27.38 
 
 
794 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  32.03 
 
 
742 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  28.31 
 
 
792 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  43.21 
 
 
274 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  46.27 
 
 
274 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  30.16 
 
 
720 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  30.47 
 
 
742 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  29.69 
 
 
742 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  28.15 
 
 
728 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  30.22 
 
 
890 aa  57  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  29.69 
 
 
742 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  29.69 
 
 
742 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  29.69 
 
 
742 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  26.99 
 
 
806 aa  56.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  30.77 
 
 
788 aa  56.2  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  34.82 
 
 
398 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  33.05 
 
 
730 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  26.42 
 
 
748 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  33.07 
 
 
485 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  32.74 
 
 
436 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  31.09 
 
 
725 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  39.51 
 
 
274 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  42.86 
 
 
287 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  30.77 
 
 
744 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  30.7 
 
 
528 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  42.68 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  28.67 
 
 
280 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  32.26 
 
 
492 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 
278 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  33.08 
 
 
760 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  33.78 
 
 
269 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  30.2 
 
 
815 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  38.81 
 
 
273 aa  52.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  24.18 
 
 
815 aa  52.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  31.15 
 
 
391 aa  52.8  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  39.29 
 
 
282 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  26.8 
 
 
453 aa  52.8  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  28.91 
 
 
742 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  36.76 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  28.12 
 
 
286 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  44.07 
 
 
275 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  36.36 
 
 
635 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  31.15 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  28.12 
 
 
296 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  36.36 
 
 
742 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  30.89 
 
 
523 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  38.27 
 
 
279 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  38.1 
 
 
749 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  25.79 
 
 
831 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  24.5 
 
 
295 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  27.87 
 
 
730 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  38.36 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  32.2 
 
 
265 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  35.29 
 
 
311 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  29.73 
 
 
515 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3955  transglutaminase domain protein  29.13 
 
 
568 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.59806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>