More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2177 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 336 aa  687    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  94.35 
 
 		 336 aa  633  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  73.65 
 
 		 337 aa  495  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  68.25 
 
 		 338 aa  488  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  46.91 
 
 		 392 aa  272  7e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  42.3 
 
 		 362 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  39.38 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  37.89 
 
 		 361 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  40.25 
 
 		 379 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  39.05 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  39.94 
 
 		 379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  39.81 
 
 		 379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  36.11 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  37.62 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  38.68 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  37.62 
 
 		 380 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  38.94 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  36.17 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  34.84 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  33.01 
 
 		 383 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  34.66 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  39.18 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  32.31 
 
 		 373 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  28.66 
 
 		 432 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  31.53 
 
 		 363 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  28.44 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  29.77 
 
 		 301 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  27.7 
 
 		 559 aa  99  9e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  26.87 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  27.16 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  32.37 
 
 		 500 aa  80.1  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  29.17 
 
 		 631 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  34.33 
 
 		 634 aa  70.1  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  31.18 
 
 		 1305 aa  69.3  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  27.73 
 
 		 818 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  31.62 
 
 		 507 aa  66.2  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  28.99 
 
 		 792 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  29.17 
 
 		 794 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  26.15 
 
 		 571 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  34.29 
 
 		 720 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  32.79 
 
 		 822 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 806 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  35.83 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  31.54 
 
 		 762 aa  60.5  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  25.7 
 
 		 742 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  31.2 
 
 		 862 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  27.42 
 
 		 635 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 728 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  25.97 
 
 		 742 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  25.97 
 
 		 742 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  25.43 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  33.56 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  41.18 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  35.48 
 
 		 890 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  25.41 
 
 		 742 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  25.41 
 
 		 742 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  25.97 
 
 		 742 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  25.41 
 
 		 742 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  35.77 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  25.41 
 
 		 742 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  32.43 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  31.09 
 
 		 730 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 826 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  39.39 
 
 		 274 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  41.98 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  34.65 
 
 		 815 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  26.23 
 
 		 810 aa  56.2  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  29.01 
 
 		 515 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  33.58 
 
 		 730 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  39.51 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  25.35 
 
 		 742 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  27.27 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 		 285 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  29.51 
 
 		 914 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  29.17 
 
 		 681 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  41.54 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  41.54 
 
 		 299 aa  53.9  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  34.75 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 		 492 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  39.51 
 
 		 275 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  28.83 
 
 		 515 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  31.43 
 
 		 485 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  33 
 
 		 767 aa  53.5  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  28.79 
 
 		 272 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  31.91 
 
 		 316 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  29.21 
 
 		 744 aa  53.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  29.22 
 
 		 280 aa  52.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  25.98 
 
 		 296 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  28.1 
 
 		 295 aa  52.8  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  21.48 
 
 		 453 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  30.85 
 
 		 528 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  32.56 
 
 		 485 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  35.8 
 
 		 279 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  29.17 
 
 		 795 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  25.98 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  32.37 
 
 		 685 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  36.23 
 
 		 273 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  25 
 
 		 748 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  32.38 
 
 		 767 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>