55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1303 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  82.11 
 
 
379 aa  670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  100 
 
 
380 aa  795    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  98.42 
 
 
380 aa  783    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  98.95 
 
 
380 aa  786    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  98.68 
 
 
380 aa  787    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  82.63 
 
 
379 aa  671    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  83.42 
 
 
379 aa  676    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  82.89 
 
 
379 aa  674    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  46.46 
 
 
362 aa  360  3e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  47.78 
 
 
359 aa  334  2e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  48.82 
 
 
361 aa  333  3e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  38.32 
 
 
369 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  36.05 
 
 
338 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  39.1 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  35.64 
 
 
366 aa  215  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  38.68 
 
 
336 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  35.04 
 
 
336 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  34.81 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  35.04 
 
 
383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  33.51 
 
 
373 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  33.65 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  34.33 
 
 
432 aa  182  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  36.36 
 
 
369 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  29.84 
 
 
371 aa  176  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  30.92 
 
 
301 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  29.52 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  28.88 
 
 
328 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  29.14 
 
 
310 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  28.25 
 
 
350 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  28.21 
 
 
500 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  28.65 
 
 
559 aa  61.6  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  26.02 
 
 
507 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  26.18 
 
 
438 aa  59.7  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  27.27 
 
 
1305 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  26.18 
 
 
438 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  25.58 
 
 
286 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  24.71 
 
 
287 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  25.58 
 
 
296 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3393  transglutaminase-like  29.19 
 
 
559 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  23.66 
 
 
571 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0171  transglutaminase domain-containing protein  25.97 
 
 
340 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1534  transglutaminase-like  28.48 
 
 
567 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.794611  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  31.53 
 
 
277 aa  47  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  27.01 
 
 
728 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  26.42 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  26.09 
 
 
788 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  29.5 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  22.18 
 
 
436 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1770  transglutaminase domain-containing protein  27.92 
 
 
556 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  32.89 
 
 
631 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  28.28 
 
 
762 aa  43.9  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  20.9 
 
 
467 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  28.38 
 
 
685 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  28.38 
 
 
685 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  25.9 
 
 
763 aa  43.1  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>