55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3074 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  82.37 
 
 
379 aa  671    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  98.95 
 
 
380 aa  786    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  98.95 
 
 
380 aa  786    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
380 aa  796    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  98.68 
 
 
380 aa  784    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  82.37 
 
 
379 aa  669    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  83.16 
 
 
379 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  82.63 
 
 
379 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  46.46 
 
 
362 aa  357  9.999999999999999e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  47.79 
 
 
359 aa  333  2e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  48.03 
 
 
361 aa  330  3e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  37.8 
 
 
369 aa  239  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  35.79 
 
 
338 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  39.1 
 
 
337 aa  222  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  35.9 
 
 
366 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  37.62 
 
 
336 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  37.11 
 
 
336 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  34.81 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  33.91 
 
 
383 aa  193  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  33.51 
 
 
373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  33.97 
 
 
392 aa  187  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  34.8 
 
 
432 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  35.87 
 
 
369 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  29.84 
 
 
371 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  30.03 
 
 
301 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  29.21 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  29.14 
 
 
328 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  28.83 
 
 
310 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  28.25 
 
 
350 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  28.21 
 
 
500 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  28.65 
 
 
559 aa  61.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  27.84 
 
 
1305 aa  60.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  26.02 
 
 
507 aa  60.1  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  26.18 
 
 
438 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  26.18 
 
 
438 aa  57.4  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  24.11 
 
 
571 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  24.38 
 
 
287 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3393  transglutaminase-like  28.34 
 
 
559 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  24.9 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  24.9 
 
 
296 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0171  transglutaminase domain-containing protein  25.97 
 
 
340 aa  47.8  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1534  transglutaminase-like  28.48 
 
 
567 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.794611  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  26.85 
 
 
788 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  30.63 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  27.21 
 
 
728 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  32.89 
 
 
631 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1770  transglutaminase domain-containing protein  27.92 
 
 
556 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  31.31 
 
 
276 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  28.28 
 
 
762 aa  43.9  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  25.47 
 
 
314 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  27.45 
 
 
260 aa  43.5  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  20.9 
 
 
467 aa  43.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  26.32 
 
 
794 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  28.38 
 
 
685 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  28.38 
 
 
685 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>