278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0138 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 320 aa  661    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  42.27 
 
 		 328 aa  267  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  33.94 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  29.79 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  31.08 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  30.63 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  29.43 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  29.52 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  27.81 
 
 		 379 aa  122  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  29.19 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  28.95 
 
 		 379 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  29.51 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  29.52 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  28.83 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  28.96 
 
 		 379 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  29.17 
 
 		 380 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  29.21 
 
 		 380 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  29.21 
 
 		 380 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  27.27 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  28.13 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  29.54 
 
 		 350 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  24.31 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  31.17 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  31.34 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  29.13 
 
 		 369 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  28.43 
 
 		 432 aa  82.4  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  27.68 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  27.06 
 
 		 631 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  26.87 
 
 		 500 aa  73.2  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  25.33 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  25.52 
 
 		 634 aa  70.5  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  28.5 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  22.94 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  26.34 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  25.2 
 
 		 571 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  26.39 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  23.53 
 
 		 436 aa  62.8  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  25.75 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  49.28 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  26.76 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  23.2 
 
 		 559 aa  61.6  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  32.73 
 
 		 792 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  25.33 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  40.66 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  26.69 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  24.89 
 
 		 507 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3978  transglutaminase-like  30.83 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  27.27 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  25.12 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  24.79 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  29.35 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  27.41 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1640  transglutaminase domain-containing protein  26.59 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  26.22 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  28.09 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  48.33 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  28.91 
 
 		 677 aa  56.6  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  23.79 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  27.78 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  50 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  39.53 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  32.71 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  30.3 
 
 		 1305 aa  55.8  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  28.79 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  36.14 
 
 		 265 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  25.46 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  24.38 
 
 		 467 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  31.62 
 
 		 762 aa  54.3  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  29.09 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  27.35 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0744  transglutaminase domain protein  33.64 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  25.58 
 
 		 720 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  32.73 
 
 		 273 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  26.39 
 
 		 259 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  32.43 
 
 		 818 aa  53.5  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  24.4 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  46.67 
 
 		 275 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  28.89 
 
 		 794 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  23.29 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  30.09 
 
 		 890 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4135  transglutaminase-like  26.86 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  27.74 
 
 		 763 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  27.14 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4491  transglutaminase domain-containing protein  26.47 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  0.176228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0636  transglutaminase domain-containing protein  31.33 
 
 		 830 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00254265  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  25.11 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  26.32 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0967  transglutaminase-like  28.3 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  hitchhiker  0.00428968 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  32.43 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  28.03 
 
 		 485 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0413  transglutaminase domain-containing protein  31.65 
 
 		 507 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  27.91 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  32.69 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  31.97 
 
 		 763 aa  50.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  32.69 
 
 		 340 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3393  transglutaminase-like  26.9 
 
 		 559 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  32.69 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  27.92 
 
 		 728 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  32.43 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  32.69 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>