46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1640 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1640  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
449 aa  923    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  45.73 
 
 
438 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  45.3 
 
 
438 aa  368  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  40.97 
 
 
453 aa  283  5.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  37.58 
 
 
436 aa  283  6.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  35.43 
 
 
467 aa  252  1e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0341  transglutaminase domain protein  27.78 
 
 
453 aa  159  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.896818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  27.97 
 
 
500 aa  94.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  23.72 
 
 
507 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  36.8 
 
 
559 aa  63.5  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  27.65 
 
 
328 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  26.59 
 
 
320 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  24.69 
 
 
362 aa  57.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  25.4 
 
 
432 aa  53.5  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  43.1 
 
 
1305 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  22.86 
 
 
373 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  32.32 
 
 
310 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  32 
 
 
631 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  36.92 
 
 
300 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  29.17 
 
 
634 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5617  transglutaminase domain protein  41.38 
 
 
517 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0710722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  25.23 
 
 
337 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  24.45 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  30.91 
 
 
361 aa  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  34.48 
 
 
263 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  29.51 
 
 
730 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  22.84 
 
 
350 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0744  transglutaminase domain protein  32.98 
 
 
397 aa  47  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0804434  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  26.2 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  31.63 
 
 
515 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  36.67 
 
 
299 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  29 
 
 
268 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 
649 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  23.86 
 
 
806 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  27.59 
 
 
681 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  25.96 
 
 
635 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  33.87 
 
 
266 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  21.01 
 
 
363 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3879  transglutaminase domain protein  25.48 
 
 
1158 aa  44.3  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  24.8 
 
 
369 aa  44.3  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  28.75 
 
 
270 aa  43.9  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  25.96 
 
 
742 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  25.96 
 
 
742 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  25.95 
 
 
274 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  35 
 
 
281 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  27.93 
 
 
281 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>