72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1221 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  100 
 
 
432 aa  886    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  39.88 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  40.18 
 
 
369 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  36.72 
 
 
369 aa  229  7e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  36.87 
 
 
366 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  36.06 
 
 
371 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  33.24 
 
 
362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  33.94 
 
 
373 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  34.53 
 
 
363 aa  199  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  34.76 
 
 
361 aa  196  7e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  37.25 
 
 
359 aa  191  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  34.48 
 
 
379 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  35.11 
 
 
380 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  35.11 
 
 
380 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  34.8 
 
 
380 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  34.17 
 
 
379 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  34.17 
 
 
379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  34.8 
 
 
380 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  34.49 
 
 
379 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  32.92 
 
 
338 aa  155  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  30.77 
 
 
301 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  30.84 
 
 
337 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  28.9 
 
 
392 aa  138  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  28.75 
 
 
336 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  28.74 
 
 
336 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  28.37 
 
 
320 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  26.4 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  28.69 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  23.84 
 
 
500 aa  63.5  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  25.38 
 
 
350 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  25.31 
 
 
507 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  34.59 
 
 
1305 aa  59.7  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  28.05 
 
 
631 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  30.46 
 
 
559 aa  57.4  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1640  transglutaminase domain-containing protein  25.4 
 
 
449 aa  53.5  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  24.62 
 
 
438 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  24.62 
 
 
438 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  46.03 
 
 
634 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  29.79 
 
 
742 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  29.08 
 
 
742 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  25.64 
 
 
281 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  32.52 
 
 
792 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  34.48 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0171  transglutaminase domain-containing protein  34.86 
 
 
340 aa  47.8  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  24.89 
 
 
762 aa  47.4  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3393  transglutaminase-like  26.67 
 
 
559 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  31.86 
 
 
635 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  30.36 
 
 
742 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  28.37 
 
 
742 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  30.36 
 
 
742 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  30.36 
 
 
742 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  30.36 
 
 
742 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  27.95 
 
 
770 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  33.33 
 
 
635 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  27.05 
 
 
453 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  24.49 
 
 
467 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  26.85 
 
 
914 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  30.36 
 
 
742 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3955  transglutaminase domain protein  28.78 
 
 
568 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.59806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  26.44 
 
 
763 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  28.17 
 
 
742 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  28.1 
 
 
272 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  26.19 
 
 
728 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  30 
 
 
649 aa  44.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1534  transglutaminase-like  27.14 
 
 
567 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.794611  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1151  transglutaminase domain protein  36.49 
 
 
764 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.301395  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3591  transglutaminase domain protein  35.16 
 
 
291 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  29.9 
 
 
274 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0156  transglutaminase-like  36.23 
 
 
799 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.0989488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  31.25 
 
 
753 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  28.87 
 
 
274 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  34.78 
 
 
276 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>