50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2790 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  98.42 
 
 		 379 aa  783    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  82.63 
 
 		 380 aa  672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  82.89 
 
 		 380 aa  673    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  82.63 
 
 		 380 aa  672    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  97.63 
 
 		 379 aa  780    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 379 aa  792    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  82.89 
 
 		 380 aa  674    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  93.4 
 
 		 379 aa  748    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  47.91 
 
 		 362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  47.41 
 
 		 359 aa  336  3.9999999999999995e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  46.56 
 
 		 361 aa  331  2e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  38.85 
 
 		 369 aa  252  7e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  41.85 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  39.25 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  36.39 
 
 		 366 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  39.94 
 
 		 336 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  38.68 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  35.16 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  34.1 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  33.16 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  34.26 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  36.16 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  32.47 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  34.17 
 
 		 432 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  32.35 
 
 		 301 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  29.43 
 
 		 320 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  30.24 
 
 		 310 aa  112  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  28.81 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  27.79 
 
 		 350 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  25.91 
 
 		 507 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  30.57 
 
 		 500 aa  62.8  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  22.74 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  29.66 
 
 		 1305 aa  59.7  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  22.74 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  27.23 
 
 		 559 aa  57.4  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  29.71 
 
 		 276 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  23.1 
 
 		 631 aa  53.1  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  23.63 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  26.9 
 
 		 762 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  29.71 
 
 		 728 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0171  transglutaminase domain-containing protein  30.65 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  22.16 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0013  transglutaminase domain protein  22.17 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.854186  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1534  transglutaminase-like  27.67 
 
 		 567 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.794611  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3393  transglutaminase-like  28.28 
 
 		 559 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  27.7 
 
 		 685 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  27.7 
 
 		 685 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  26.9 
 
 		 484 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  22.52 
 
 		 571 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  24.64 
 
 		 788 aa  42.7  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>