52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1405 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  100 
 
 		 379 aa  790    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  82.11 
 
 		 380 aa  670    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  82.37 
 
 		 380 aa  669    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  82.37 
 
 		 380 aa  671    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  82.37 
 
 		 380 aa  671    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  94.46 
 
 		 379 aa  754    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  93.67 
 
 		 379 aa  750    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  93.4 
 
 		 379 aa  748    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  48.69 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  47.63 
 
 		 359 aa  339  4e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  47.09 
 
 		 361 aa  332  5e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  39.11 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  39.02 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  40.89 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  36.98 
 
 		 366 aa  222  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  39.25 
 
 		 336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  38.87 
 
 		 336 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  34.86 
 
 		 373 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  34.2 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  33.68 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  32.9 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  36.25 
 
 		 392 aa  190  4e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  32.55 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  34.48 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  32.13 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  27.81 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  29.29 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  27.83 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  27.11 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  26 
 
 		 507 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  30.14 
 
 		 1305 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  24.43 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  28.32 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  24.43 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  27.89 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  23.61 
 
 		 631 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  28.17 
 
 		 276 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  21.98 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3393  transglutaminase-like  28.97 
 
 		 559 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  29.93 
 
 		 728 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0171  transglutaminase domain-containing protein  30.65 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  21.01 
 
 		 467 aa  47.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  27.59 
 
 		 762 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  22.07 
 
 		 571 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1770  transglutaminase domain-containing protein  27.54 
 
 		 556 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  24.07 
 
 		 763 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  25.71 
 
 		 314 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  26.67 
 
 		 277 aa  43.9  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1534  transglutaminase-like  28.3 
 
 		 567 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.794611  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3069  transglutaminase domain protein  27.59 
 
 		 371 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0588  transglutaminase domain protein  27.78 
 
 		 574 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.618146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0013  transglutaminase domain protein  22.92 
 
 		 376 aa  43.1  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.854186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>