64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2413 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  100 
 
 
369 aa  763    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  45.7 
 
 
366 aa  292  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  43.97 
 
 
369 aa  285  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  47.34 
 
 
383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  37.06 
 
 
361 aa  258  8e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  39.11 
 
 
379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  39.11 
 
 
379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  38.85 
 
 
379 aa  252  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  38.42 
 
 
359 aa  251  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  38.58 
 
 
379 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  38.32 
 
 
380 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  38.32 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  37.09 
 
 
362 aa  244  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  38.06 
 
 
380 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  43.03 
 
 
373 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  37.8 
 
 
380 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  40.59 
 
 
363 aa  235  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  38.71 
 
 
371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  36.83 
 
 
432 aa  229  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  39.94 
 
 
338 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  39.31 
 
 
337 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  38.94 
 
 
336 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  37.81 
 
 
336 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  39.13 
 
 
301 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  33.23 
 
 
392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  28.13 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  28.12 
 
 
328 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  29.56 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  28.69 
 
 
559 aa  69.3  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  25.6 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  29.57 
 
 
571 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  38.94 
 
 
1305 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  27.05 
 
 
436 aa  56.2  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  24.7 
 
 
634 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  26.42 
 
 
631 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  27.15 
 
 
762 aa  50.4  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  27.84 
 
 
254 aa  50.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  26.75 
 
 
507 aa  49.7  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0171  transglutaminase domain-containing protein  26.97 
 
 
340 aa  49.7  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  24.5 
 
 
453 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  26.59 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  26.7 
 
 
285 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  29.17 
 
 
826 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  30.2 
 
 
728 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  27.62 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  26.79 
 
 
753 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  25.65 
 
 
645 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  33.94 
 
 
818 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  31.43 
 
 
500 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  23.83 
 
 
438 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1640  transglutaminase domain-containing protein  24.8 
 
 
449 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  26.58 
 
 
798 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  23.78 
 
 
261 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  27.13 
 
 
286 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  26.14 
 
 
742 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  26.61 
 
 
343 aa  43.5  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  28.65 
 
 
269 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  28.74 
 
 
800 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  22.92 
 
 
438 aa  43.1  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  23.35 
 
 
467 aa  43.1  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0068  transglutaminase domain protein  28.69 
 
 
373 aa  42.7  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0531153  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  35.53 
 
 
654 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  27.13 
 
 
286 aa  42.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  29.6 
 
 
794 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>