50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0665 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
371 aa  752    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  54.2 
 
 
366 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  54.25 
 
 
383 aa  362  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  51.61 
 
 
373 aa  347  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  43.83 
 
 
369 aa  289  7e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  48.37 
 
 
363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  38.71 
 
 
369 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  43.05 
 
 
301 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  36.06 
 
 
432 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  34.32 
 
 
361 aa  194  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  33.51 
 
 
379 aa  192  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  32.99 
 
 
379 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  32.62 
 
 
359 aa  191  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  32.35 
 
 
362 aa  189  5e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  33.25 
 
 
379 aa  189  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  33.16 
 
 
379 aa  189  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  31.25 
 
 
380 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  31.07 
 
 
380 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  30.81 
 
 
380 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  31.11 
 
 
380 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  36.33 
 
 
338 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  37.59 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  39.18 
 
 
336 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  38.06 
 
 
336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30.77 
 
 
392 aa  136  7.000000000000001e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  27.44 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  27.68 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  27.37 
 
 
818 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  30.82 
 
 
822 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  25.65 
 
 
310 aa  57  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  26.37 
 
 
631 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  29.79 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  29.71 
 
 
1305 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0251  transglutaminase-like protein  27.48 
 
 
851 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0634947  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  21.8 
 
 
436 aa  50.4  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  29.32 
 
 
559 aa  50.4  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  32 
 
 
794 aa  49.3  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  35.14 
 
 
685 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  35.14 
 
 
685 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  26.83 
 
 
500 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  25.47 
 
 
571 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  34.15 
 
 
398 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0341  transglutaminase domain protein  27.27 
 
 
453 aa  46.6  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.896818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  36.04 
 
 
254 aa  46.2  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  23.01 
 
 
728 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  26.71 
 
 
792 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  29.03 
 
 
762 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1061  transglutaminase domain-containing protein  26.62 
 
 
314 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  36.76 
 
 
634 aa  43.9  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  29.14 
 
 
886 aa  43.1  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>