97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3586 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 363 aa  741    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  50.14 
 
 		 373 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  47.18 
 
 		 383 aa  279  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  45.63 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  48.79 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  40.59 
 
 		 369 aa  235  8e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  44.33 
 
 		 301 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  39.73 
 
 		 369 aa  226  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  33.42 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 359 aa  203  4e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  35.06 
 
 		 380 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  34.81 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  34.81 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  34.53 
 
 		 432 aa  199  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  34.55 
 
 		 380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  34.77 
 
 		 379 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  33.68 
 
 		 379 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  34.26 
 
 		 379 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  33.68 
 
 		 379 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  32.8 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  34.73 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  33.44 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  33.96 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  31.19 
 
 		 336 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  31.53 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  26.94 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  25.33 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  26.48 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  33.87 
 
 		 1305 aa  60.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  39.09 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  26.07 
 
 		 500 aa  59.7  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  31.5 
 
 		 571 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  24.88 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  22.41 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  27.1 
 
 		 730 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  28.21 
 
 		 818 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  24.12 
 
 		 631 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  31.33 
 
 		 792 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  31.86 
 
 		 635 aa  50.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  30.53 
 
 		 890 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  29.21 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  28.07 
 
 		 798 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  27.05 
 
 		 730 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  38.24 
 
 		 634 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  29.58 
 
 		 674 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  29.58 
 
 		 674 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  25.57 
 
 		 507 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  23.95 
 
 		 794 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  26.86 
 
 		 559 aa  46.6  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  26.12 
 
 		 744 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  25.93 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  32.61 
 
 		 649 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  26.03 
 
 		 685 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0251  transglutaminase-like protein  25.87 
 
 		 851 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0634947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  25.4 
 
 		 644 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  26.05 
 
 		 685 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  25.6 
 
 		 795 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0068  transglutaminase domain protein  32.46 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0531153  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0171  transglutaminase domain-containing protein  28.68 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  22.01 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  28.17 
 
 		 681 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  27.42 
 
 		 681 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  32.8 
 
 		 743 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  37.5 
 
 		 274 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  25.82 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  31.37 
 
 		 662 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  31.19 
 
 		 706 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  26.98 
 
 		 1238 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1640  transglutaminase domain-containing protein  21.01 
 
 		 449 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  29.41 
 
 		 680 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  33.33 
 
 		 739 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0341  transglutaminase domain protein  24.02 
 
 		 453 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 739 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  37.14 
 
 		 274 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  37.63 
 
 		 510 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  24.04 
 
 		 644 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  26.92 
 
 		 788 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 		 720 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  31.71 
 
 		 862 aa  43.5  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  34.15 
 
 		 732 aa  43.5  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  28 
 
 		 767 aa  43.5  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  30.48 
 
 		 734 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  30.48 
 
 		 734 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  34.62 
 
 		 676 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 707 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  25 
 
 		 767 aa  43.1  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  24.23 
 
 		 748 aa  43.1  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  30.48 
 
 		 715 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  30.48 
 
 		 715 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  26.28 
 
 		 822 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  30.43 
 
 		 436 aa  43.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  26.32 
 
 		 827 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  30.48 
 
 		 715 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  36.76 
 
 		 287 aa  43.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  27.62 
 
 		 705 aa  42.7  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  27.27 
 
 		 674 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  31.53 
 
 		 261 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>