160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04340 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  100 
 
 
392 aa  791    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  46.42 
 
 
336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  46.73 
 
 
336 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  46.52 
 
 
338 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  44.94 
 
 
337 aa  270  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  38.03 
 
 
362 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  36.66 
 
 
359 aa  205  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  35.16 
 
 
361 aa  202  6e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  36.01 
 
 
379 aa  193  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  35.93 
 
 
379 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  36.01 
 
 
379 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  36.12 
 
 
379 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  34.14 
 
 
380 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  33.64 
 
 
380 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  33.97 
 
 
380 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
380 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  33.23 
 
 
369 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  33.44 
 
 
366 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  30.52 
 
 
369 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  31.65 
 
 
383 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  34.81 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  28.14 
 
 
432 aa  145  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  30.57 
 
 
373 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  33.85 
 
 
363 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  30.86 
 
 
371 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  29.51 
 
 
320 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  27.49 
 
 
301 aa  96.7  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  26.46 
 
 
310 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  27.16 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  29.78 
 
 
559 aa  76.3  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  27.27 
 
 
500 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  27.51 
 
 
571 aa  66.2  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  30.4 
 
 
1305 aa  63.9  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  27.78 
 
 
634 aa  63.9  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  36 
 
 
507 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  25.39 
 
 
631 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  27.33 
 
 
528 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  30.95 
 
 
822 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  31.4 
 
 
782 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  27.81 
 
 
730 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  28.97 
 
 
438 aa  54.3  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  26.8 
 
 
438 aa  53.9  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  28.46 
 
 
274 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  30.09 
 
 
436 aa  53.1  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  29.82 
 
 
398 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  30.77 
 
 
269 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  30.17 
 
 
274 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  45.31 
 
 
275 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  27.34 
 
 
635 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  26.8 
 
 
453 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0171  transglutaminase domain-containing protein  27.92 
 
 
340 aa  50.8  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 
792 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  25.56 
 
 
467 aa  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  34.07 
 
 
282 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  27.78 
 
 
515 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  26.77 
 
 
742 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  38.33 
 
 
300 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  28.76 
 
 
827 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  28.1 
 
 
762 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  29.17 
 
 
818 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  27.78 
 
 
515 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3591  transglutaminase domain protein  36.51 
 
 
291 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  32.79 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  39.34 
 
 
274 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  28.26 
 
 
288 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  30.4 
 
 
794 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  29.69 
 
 
720 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  37.5 
 
 
299 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  26.36 
 
 
211 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3955  transglutaminase domain protein  25.5 
 
 
568 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.59806 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  37.7 
 
 
274 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1051  transglutaminase-like  35 
 
 
285 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.647734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  24.87 
 
 
523 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  37.5 
 
 
943 aa  47.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11441  transglutaminase-like superfamily protein  35 
 
 
285 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11451  transglutaminase-like superfamily protein  35 
 
 
285 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  33.58 
 
 
743 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  25.87 
 
 
798 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  38.81 
 
 
296 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  38.81 
 
 
286 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  28.16 
 
 
649 aa  47.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  26.92 
 
 
742 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  42.11 
 
 
273 aa  47  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  37.88 
 
 
279 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  25.78 
 
 
742 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  26.72 
 
 
742 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  26.04 
 
 
681 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1117  transglutaminase domain protein  32.79 
 
 
563 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.672315  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0731  transglutaminase-like  35 
 
 
281 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.149665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  27.27 
 
 
216 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  35.71 
 
 
635 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  27.68 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  27.68 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  22.83 
 
 
266 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15691  transglutaminase-like superfamily protein  26.45 
 
 
281 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798972  normal  0.306347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  42.19 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  28.95 
 
 
478 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1088  transglutaminase domain protein  32.79 
 
 
563 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  29.51 
 
 
730 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0588  transglutaminase domain protein  26.71 
 
 
574 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.618146  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>