275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1086 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  100 
 
 
338 aa  692    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  71.81 
 
 
337 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  69.25 
 
 
336 aa  481  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  71.2 
 
 
336 aa  481  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  46.43 
 
 
392 aa  262  4.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  40.11 
 
 
362 aa  241  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  39.02 
 
 
379 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  40.68 
 
 
379 aa  227  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  39.25 
 
 
379 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  39.25 
 
 
379 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  35.79 
 
 
380 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  36.05 
 
 
380 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  35.79 
 
 
380 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  38.56 
 
 
380 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  39.02 
 
 
361 aa  220  3e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  38.48 
 
 
359 aa  217  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  39.94 
 
 
369 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  35.91 
 
 
366 aa  186  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  35.1 
 
 
369 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  36.33 
 
 
371 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  33.97 
 
 
383 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  34.95 
 
 
373 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  31.87 
 
 
328 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  32.61 
 
 
432 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  33.44 
 
 
363 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  30.63 
 
 
320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  30.31 
 
 
301 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  26.1 
 
 
310 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  27.27 
 
 
559 aa  87.8  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  27.1 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  29.15 
 
 
500 aa  83.2  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  33.85 
 
 
1305 aa  74.3  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  27.45 
 
 
634 aa  73.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  30.6 
 
 
794 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  33.52 
 
 
818 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  23.55 
 
 
507 aa  69.7  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  29.33 
 
 
631 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  35.25 
 
 
822 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  31.03 
 
 
762 aa  67.8  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
862 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  27.07 
 
 
571 aa  62.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  32.03 
 
 
742 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  31.25 
 
 
635 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  32.61 
 
 
792 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  31.25 
 
 
742 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  32.85 
 
 
730 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  31.25 
 
 
742 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  31.3 
 
 
728 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  32.09 
 
 
730 aa  59.7  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  30.47 
 
 
742 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  33.06 
 
 
720 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  30.95 
 
 
806 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  24.36 
 
 
467 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  31.43 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  29.69 
 
 
742 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  29.69 
 
 
742 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  30.47 
 
 
742 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  29.69 
 
 
742 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  32.14 
 
 
890 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  32.35 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  29.69 
 
 
742 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  34.96 
 
 
815 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  32.46 
 
 
528 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  28.86 
 
 
681 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  26.85 
 
 
436 aa  57  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  31.5 
 
 
274 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  40.48 
 
 
274 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  26 
 
 
295 aa  56.6  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  33.08 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  40.3 
 
 
274 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  31.62 
 
 
492 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  34.96 
 
 
826 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  29.51 
 
 
914 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  26.45 
 
 
748 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  32.31 
 
 
391 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  35.82 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  27.66 
 
 
280 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  44.07 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  25.37 
 
 
453 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  32.56 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  27.74 
 
 
782 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  29.8 
 
 
485 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  39.29 
 
 
275 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  29.69 
 
 
788 aa  53.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  28.29 
 
 
725 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  38.1 
 
 
282 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  24.69 
 
 
810 aa  52.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  42.42 
 
 
276 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  28.78 
 
 
645 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  25.38 
 
 
815 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1770  transglutaminase domain-containing protein  33.77 
 
 
556 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  48.53 
 
 
943 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  38.1 
 
 
749 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  38.36 
 
 
308 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  33 
 
 
767 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  32.8 
 
 
760 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  36.51 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  34.57 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  30.06 
 
 
744 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  35.29 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>