129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0260 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 350 aa  721    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  34.17 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  28.77 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  28.25 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  28.25 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  28.25 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  28.25 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  27.37 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  29.69 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  28.49 
 
 		 379 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  27.68 
 
 		 379 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  30.34 
 
 		 500 aa  89.4  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  27.92 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  27.11 
 
 		 379 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  27.16 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  26.59 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  26.43 
 
 		 338 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  26.82 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  25.64 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  27.41 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  28.98 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  29.09 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  25.35 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  31.78 
 
 		 1305 aa  63.5  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  26.48 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  30.25 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  25.84 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  31.93 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  25.6 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  26.23 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  32.26 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  29.52 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  34.62 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  27.13 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3393  transglutaminase-like  25.79 
 
 		 559 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  39.02 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  24.52 
 
 		 467 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0588  transglutaminase domain protein  26.32 
 
 		 574 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.618146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1534  transglutaminase-like  26.04 
 
 		 567 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.794611  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  29.79 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  40 
 
 		 273 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  32.81 
 
 		 275 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3069  transglutaminase domain protein  25.42 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1770  transglutaminase domain-containing protein  26.92 
 
 		 556 aa  53.5  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  36 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  28.03 
 
 		 914 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  39.71 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  31.2 
 
 		 296 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  31.2 
 
 		 286 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  42.37 
 
 		 275 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  30.95 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0341  transglutaminase domain protein  23.66 
 
 		 453 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  35.96 
 
 		 317 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  37.33 
 
 		 270 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  27.52 
 
 		 818 aa  49.7  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  28.99 
 
 		 771 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  36.23 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1555  transglutaminase domain-containing protein  26.85 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  34.09 
 
 		 689 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  39.39 
 
 		 732 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  25.97 
 
 		 795 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  27.57 
 
 		 484 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  36.76 
 
 		 274 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  42.86 
 
 		 275 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  28.05 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  24.89 
 
 		 653 aa  47  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  37.88 
 
 		 715 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  37.88 
 
 		 715 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  31.76 
 
 		 698 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1640  transglutaminase domain-containing protein  22.84 
 
 		 449 aa  47  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  37.88 
 
 		 715 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  32.18 
 
 		 674 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  28.95 
 
 		 515 aa  46.6  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  27.05 
 
 		 634 aa  46.6  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  24.64 
 
 		 667 aa  46.6  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0413  transglutaminase domain-containing protein  27.74 
 
 		 507 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  38.98 
 
 		 287 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  36.76 
 
 		 274 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  32.47 
 
 		 571 aa  46.2  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  21.25 
 
 		 754 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  25.5 
 
 		 794 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  31.65 
 
 		 492 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  27.64 
 
 		 689 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  32.35 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  37.88 
 
 		 826 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  37.84 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  26.61 
 
 		 822 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 		 631 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  34.29 
 
 		 742 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  34.29 
 
 		 742 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  34.29 
 
 		 742 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  33.33 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  39.39 
 
 		 268 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0171  transglutaminase domain-containing protein  22.76 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  26.67 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  31.45 
 
 		 806 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  37.88 
 
 		 815 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  31.75 
 
 		 654 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  34.62 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 266 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>