More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0053 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  100 
 
 		 484 aa  972    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  58.8 
 
 		 515 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  56.79 
 
 		 485 aa  553  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  52.43 
 
 		 478 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  52.99 
 
 		 478 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  47.06 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  47.24 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0148  transglutaminase domain-containing protein  26.99 
 
 		 495 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  27.16 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  26.81 
 
 		 515 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4075  transglutaminase-like  26.06 
 
 		 515 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  36.11 
 
 		 1305 aa  87.4  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  43.4 
 
 		 510 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  34.15 
 
 		 559 aa  70.5  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  33.55 
 
 		 634 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  35 
 
 		 269 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5617  transglutaminase domain protein  42.86 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0710722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  28.46 
 
 		 528 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  37.89 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  37.61 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  28.14 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  35.48 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  29.87 
 
 		 571 aa  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  31.08 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  26.47 
 
 		 280 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  34.38 
 
 		 632 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  29.06 
 
 		 523 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  34.38 
 
 		 632 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  27.59 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  27.59 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  35.85 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  31.87 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  33.65 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  36.26 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3494  transglutaminase domain protein  27.97 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3562  transglutaminase domain protein  27.97 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  31.78 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0784  transglutaminase domain protein  22.89 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 		 280 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  31.01 
 
 		 274 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  34.07 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 		 275 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  32.67 
 
 		 689 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  32.46 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  29 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5097  hypothetical protein  38.96 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  34.44 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  31.03 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  37.36 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  32.1 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  30.16 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  32.98 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  29.71 
 
 		 631 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  30.56 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  34 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  33.05 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  34.82 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  29.84 
 
 		 631 aa  57.4  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1984  transglutaminase-like  33.7 
 
 		 291 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 		 366 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  30.56 
 
 		 266 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  37.23 
 
 		 282 aa  57  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  33.72 
 
 		 276 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  28 
 
 		 266 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  33.72 
 
 		 276 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  34.07 
 
 		 270 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  27.14 
 
 		 316 aa  56.6  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  31.93 
 
 		 272 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4490  transglutaminase domain protein  30.82 
 
 		 296 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4426  transglutaminase domain protein  30.82 
 
 		 296 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  30.56 
 
 		 266 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  26.98 
 
 		 280 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1814  transglutaminase domain protein  40.26 
 
 		 290 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070269  hitchhiker  0.00579618 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  31.82 
 
 		 266 aa  55.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3591  transglutaminase domain protein  26.67 
 
 		 291 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  32.71 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  31.4 
 
 		 316 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  37.27 
 
 		 293 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  32 
 
 		 276 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04320  transglutaminase domain protein  31.82 
 
 		 1118 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2008  transglutaminase domain protein  40.26 
 
 		 290 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  31.46 
 
 		 272 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  32.5 
 
 		 258 aa  55.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  31.01 
 
 		 676 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  29.1 
 
 		 644 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1847  transglutaminase-like  29.79 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  29.84 
 
 		 500 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  28.15 
 
 		 637 aa  54.7  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  30.46 
 
 		 276 aa  54.7  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  27.61 
 
 		 644 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  32.71 
 
 		 288 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  37.36 
 
 		 300 aa  54.3  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  26.88 
 
 		 292 aa  54.3  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  38.2 
 
 		 288 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  28.83 
 
 		 279 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  28.83 
 
 		 279 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  28.83 
 
 		 279 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  31.46 
 
 		 272 aa  53.9  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  32.5 
 
 		 319 aa  53.9  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>