More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5097 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5097  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  616  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1814  transglutaminase domain protein  75.78 
 
 		 290 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070269  hitchhiker  0.00579618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2008  transglutaminase domain protein  77.16 
 
 		 290 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5604  transglutaminase domain-containing protein  54.55 
 
 		 309 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.639349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3978  transglutaminase-like  52.25 
 
 		 304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2635  transglutaminase domain-containing protein  51.36 
 
 		 311 aa  300  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000599705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0967  transglutaminase-like  50.17 
 
 		 301 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  hitchhiker  0.00428968 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4135  transglutaminase-like  50.87 
 
 		 304 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1847  transglutaminase-like  51.2 
 
 		 300 aa  290  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3281  transglutaminase-like domain-containing protein  48.82 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1823  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1264  transglutaminase domain protein  47.85 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000508842  normal  0.510233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2469  transglutaminase domain-containing protein  46.02 
 
 		 313 aa  265  8.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.451679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2984  transglutaminase domain protein  46.78 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0273  transglutaminase domain-containing protein  48.45 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.260289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1061  transglutaminase domain-containing protein  44.6 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1408  transglutaminase domain protein  45.89 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.543659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2753  transglutaminase-like  43.94 
 
 		 288 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1555  transglutaminase domain-containing protein  42.91 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4755  transglutaminase domain protein  42.36 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1814  transglutaminase domain protein  42.36 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.853279 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1611  transglutaminase domain protein  40.42 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  38.46 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3324  transglutaminase domain-containing protein  39.6 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1984  transglutaminase-like  36.03 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  42.29 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9053  hypothetical protein  42.15 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4406  transglutaminase domain protein  32.45 
 
 		 1157 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0725  transglutaminase family protein  32.12 
 
 		 1157 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3334  transglutaminase domain protein  35.34 
 
 		 1139 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387126  normal  0.0234354 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4489  transglutaminase domain-containing protein  32.17 
 
 		 1142 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3099  transglutaminase-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 1116 aa  149  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.595628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3159  transglutaminase-like  32.29 
 
 		 1217 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.668757  normal  0.863803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1621  transglutaminase domain-containing protein  32.66 
 
 		 1091 aa  148  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0187167 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4005  transglutaminase domain-containing protein  32.13 
 
 		 1144 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962784  normal  0.211891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0210  transglutaminase domain protein  32.53 
 
 		 1122 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3412  transglutaminase domain-containing protein  32.18 
 
 		 1137 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2553  transglutaminase-like superfamily protein  33.9 
 
 		 1169 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4255  transglutaminase-like  32.18 
 
 		 1137 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253349  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3522  transglutaminase domain-containing protein  32.49 
 
 		 1149 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4111  transglutaminase domain-containing protein  32.18 
 
 		 1137 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2246  transglutaminase domain protein  33 
 
 		 1145 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.637206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3585  transglutaminase-like  35.14 
 
 		 1128 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.222679  normal  0.726735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2320  transglutaminase-like protein  33.22 
 
 		 1108 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0950324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2367  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 		 1108 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.021822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2359  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 		 1108 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3415  transglutaminase domain-containing protein  33.69 
 
 		 1116 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3724  transglutaminase domain protein  33.69 
 
 		 1116 aa  146  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.565418  normal  0.0894015 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1496  transglutaminase domain protein  32.29 
 
 		 1188 aa  146  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1218  transglutaminase domain-containing protein  32.2 
 
 		 1135 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.695465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3010  transglutaminase-like  31.67 
 
 		 1117 aa  146  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.424161 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3879  transglutaminase domain protein  33.1 
 
 		 1158 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4657  transglutaminase domain protein  31.32 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0067  transglutaminase-like  32.16 
 
 		 1147 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1933  transglutaminase-like  32.13 
 
 		 1142 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1712  transglutaminase-like  34.13 
 
 		 1114 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.347512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1701  transglutaminase-like  32.36 
 
 		 1090 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126756  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2524  transglutaminase domain protein  34.04 
 
 		 1120 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0515  transglutaminase domain-containing protein  32.26 
 
 		 1136 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2907  transglutaminase-like domain protein  34.04 
 
 		 1120 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1065  transglutaminase domain-containing protein  30.45 
 
 		 1121 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.417532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0655  transglutaminase domain-containing protein  32.64 
 
 		 1097 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.559922  hitchhiker  0.000135984 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4110  transglutaminase domain-containing protein  31.05 
 
 		 1148 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0541  transglutaminase-like  33.11 
 
 		 1091 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.649463  normal  0.642878 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1309  Protein of unknown function DUF2126  31.52 
 
 		 1100 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.544002  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3033  transglutaminase domain-containing protein  31.6 
 
 		 1100 aa  142  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2470  transglutaminase domain-containing protein  31.8 
 
 		 1122 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42853 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1919  transglutaminase domain-containing protein  31.58 
 
 		 1145 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3771  transglutaminase domain-containing protein  33.21 
 
 		 1133 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510583  normal  0.20356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3343  transglutaminase domain protein  33.45 
 
 		 1108 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3752  hypothetical protein  31.45 
 
 		 1114 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139209  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2558  transglutaminase-like  32.53 
 
 		 1090 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.884999  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2605  transglutaminase domain-containing protein  31.49 
 
 		 1174 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2947  hypothetical protein  33.45 
 
 		 1103 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104803 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1778  transglutaminase domain-containing protein  31.93 
 
 		 1140 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.527948  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0770  transglutaminase domain-containing protein  31.93 
 
 		 1140 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5075  transglutaminase domain-containing protein  33.1 
 
 		 1080 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.804608  normal  0.120829 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1063  transglutaminase domain-containing protein  31.93 
 
 		 1140 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2038  transglutaminase domain-containing protein  31.93 
 
 		 1140 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.654776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3405  transglutaminase domain protein  29.89 
 
 		 1180 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2055  transglutaminase-like superfamily protein  32.37 
 
 		 1140 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0769  transglutaminase domain-containing protein  32.37 
 
 		 1140 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106544  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0678  transglutaminase domain-containing protein  32.37 
 
 		 1140 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0988  transglutaminase domain-containing protein  31.54 
 
 		 1119 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04320  transglutaminase domain protein  34.16 
 
 		 1118 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0588  transglutaminase-like  31.88 
 
 		 1092 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.332727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3645  transglutaminase domain protein  33.09 
 
 		 1108 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1014  transglutaminase domain protein  32.72 
 
 		 1128 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2628  transglutaminase domain-containing protein  31.21 
 
 		 1112 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4926  transglutaminase-like superfamily domain protein  32.31 
 
 		 1092 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4275  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 1113 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0684346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5370  transglutaminase domain protein  32.27 
 
 		 1081 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3608  transglutaminase domain protein  30.6 
 
 		 1104 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  0.238952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1392  transglutaminase-like enzyme, cysteine protease  30.38 
 
 		 1151 aa  135  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.284441  normal  0.67203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  35.51 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2637  transglutaminase domain-containing protein  32.06 
 
 		 1091 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0330314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0857  transglutaminase domain protein  30.84 
 
 		 1112 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250645  normal  0.314962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0393  transglutaminase domain-containing protein  30.54 
 
 		 1114 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2315  Protein of unknown function DUF2126  33.33 
 
 		 1155 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  31.82 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2614  transglutaminase domain-containing protein  32.03 
 
 		 1107 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.95635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>