111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0089 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  100 
 
 
559 aa  1144    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  27.7 
 
 
336 aa  99.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  27.66 
 
 
337 aa  94.7  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  28.32 
 
 
500 aa  91.3  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  25.94 
 
 
336 aa  90.5  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  27.27 
 
 
338 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  39.58 
 
 
453 aa  84.3  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  28.2 
 
 
507 aa  83.6  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  36.22 
 
 
1305 aa  83.6  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  28.36 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  29.78 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  26.69 
 
 
359 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0341  transglutaminase domain protein  25.36 
 
 
453 aa  72.4  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.896818 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  26.95 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0614  IPT/TIG domain protein  22.91 
 
 
518 aa  72  0.00000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  34.15 
 
 
484 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  28.69 
 
 
369 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  34.25 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  34.25 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  26.04 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  24.64 
 
 
328 aa  67  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  31.25 
 
 
485 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  34.78 
 
 
478 aa  66.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  32.35 
 
 
383 aa  65.1  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  32.17 
 
 
478 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  26.36 
 
 
436 aa  63.9  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  41.56 
 
 
634 aa  63.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1640  transglutaminase domain-containing protein  36.8 
 
 
449 aa  63.5  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  28.65 
 
 
380 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  23.2 
 
 
320 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  28.65 
 
 
380 aa  61.2  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  28.8 
 
 
380 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  28.65 
 
 
380 aa  60.8  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  27.03 
 
 
366 aa  60.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  24.6 
 
 
373 aa  60.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  27.04 
 
 
369 aa  60.1  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  27.89 
 
 
379 aa  59.3  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  27.7 
 
 
379 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  28.68 
 
 
280 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1770  transglutaminase domain-containing protein  22.66 
 
 
556 aa  58.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  30.46 
 
 
432 aa  57.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  27.23 
 
 
379 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  27.23 
 
 
379 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  26 
 
 
795 aa  57.4  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  25.82 
 
 
467 aa  57  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  27.59 
 
 
515 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3393  transglutaminase-like  22.79 
 
 
559 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0588  transglutaminase domain protein  19.85 
 
 
574 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.618146  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3069  transglutaminase domain protein  20.34 
 
 
371 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1534  transglutaminase-like  21.96 
 
 
567 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.794611  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3955  transglutaminase domain protein  21.83 
 
 
568 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.59806 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  25.71 
 
 
492 aa  53.5  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  25.37 
 
 
571 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 
822 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  35.35 
 
 
485 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  30.95 
 
 
634 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1088  transglutaminase domain protein  20.37 
 
 
563 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1117  transglutaminase domain protein  20.37 
 
 
563 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.672315  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  30.61 
 
 
634 aa  50.8  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  29.73 
 
 
528 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  29.32 
 
 
371 aa  50.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  28.89 
 
 
681 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  27.43 
 
 
282 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  30.15 
 
 
753 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  27.33 
 
 
762 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  31.78 
 
 
515 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  31.78 
 
 
515 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  28.35 
 
 
391 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  43.4 
 
 
273 aa  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  28 
 
 
269 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0784  transglutaminase domain protein  28.12 
 
 
525 aa  47.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  27.78 
 
 
890 aa  47.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  29.31 
 
 
794 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  33.33 
 
 
265 aa  47.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  27.56 
 
 
391 aa  47.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  29.57 
 
 
311 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  27.27 
 
 
806 aa  47.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  39.34 
 
 
300 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  25 
 
 
792 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  29.31 
 
 
323 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  25.86 
 
 
363 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  27.08 
 
 
269 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  25.71 
 
 
818 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  28.83 
 
 
523 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  29.67 
 
 
273 aa  45.8  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  38.24 
 
 
287 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  27.06 
 
 
268 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0731  transglutaminase-like  37.93 
 
 
281 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.149665  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15691  transglutaminase-like superfamily protein  26.32 
 
 
281 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798972  normal  0.306347 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  29.76 
 
 
638 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  26.12 
 
 
268 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  40.28 
 
 
282 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1556  transglutaminase domain-containing protein  28.07 
 
 
272 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  23.32 
 
 
790 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  37.5 
 
 
274 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  35.21 
 
 
275 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3494  transglutaminase domain protein  27.93 
 
 
523 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3562  transglutaminase domain protein  27.93 
 
 
523 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  37.5 
 
 
274 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1555  transglutaminase domain-containing protein  35.21 
 
 
290 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>