53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0171 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0171  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
340 aa  690    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  27.99 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  23.26 
 
 
379 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  25.48 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  23.02 
 
 
453 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  32.1 
 
 
270 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  25.19 
 
 
1305 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  27.92 
 
 
392 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  27.16 
 
 
634 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  21.19 
 
 
380 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  34.67 
 
 
338 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  26.4 
 
 
467 aa  50.1  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  21.48 
 
 
350 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  26.97 
 
 
369 aa  50.1  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  35.44 
 
 
361 aa  50.1  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
337 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  25 
 
 
432 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  31.25 
 
 
266 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  26.94 
 
 
810 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  25.97 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  23.24 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  25.97 
 
 
380 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  25.97 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  23.24 
 
 
379 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  34.21 
 
 
850 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  22.11 
 
 
379 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  32 
 
 
336 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  28.33 
 
 
359 aa  47  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  36.23 
 
 
763 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  23.48 
 
 
631 aa  46.6  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  32.47 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  31.25 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  27.43 
 
 
790 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
681 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  29.31 
 
 
736 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  30.95 
 
 
790 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  30.65 
 
 
782 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  28.68 
 
 
363 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0341  transglutaminase domain protein  29.67 
 
 
453 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.896818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  30.67 
 
 
336 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  25.55 
 
 
278 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  29.87 
 
 
383 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  25.56 
 
 
890 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  26.74 
 
 
366 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  32.89 
 
 
654 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  32 
 
 
783 aa  43.1  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  33.75 
 
 
438 aa  42.7  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1117  transglutaminase domain-containing protein  23 
 
 
328 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.113705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  31.52 
 
 
274 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  26.09 
 
 
269 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  33.75 
 
 
438 aa  42.7  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  31.25 
 
 
812 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  32.94 
 
 
788 aa  42.7  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>