59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0744 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0744  transglutaminase domain protein  100 
 
 
397 aa  795    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0804434  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  29.31 
 
 
500 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  30.32 
 
 
275 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  26.02 
 
 
507 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  30 
 
 
467 aa  58.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  30.57 
 
 
274 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  30.63 
 
 
274 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  33.64 
 
 
320 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  29.85 
 
 
299 aa  53.5  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  33.63 
 
 
300 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  22.56 
 
 
453 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  25.64 
 
 
273 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  29.17 
 
 
266 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  31.87 
 
 
282 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  28.73 
 
 
266 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  25.38 
 
 
328 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  29.86 
 
 
631 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11451  transglutaminase-like superfamily protein  30.97 
 
 
285 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  32.63 
 
 
438 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  31.01 
 
 
279 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1051  transglutaminase-like  30.97 
 
 
285 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.647734  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  32.63 
 
 
438 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  30.86 
 
 
492 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11441  transglutaminase-like superfamily protein  30.97 
 
 
285 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  23.94 
 
 
280 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  28.35 
 
 
571 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  38.36 
 
 
326 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  26.98 
 
 
265 aa  47.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  35.21 
 
 
732 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  40.54 
 
 
323 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  30.77 
 
 
634 aa  47  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1640  transglutaminase domain-containing protein  32.98 
 
 
449 aa  47  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  35.21 
 
 
709 aa  47  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  33.8 
 
 
715 aa  46.6  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  29.46 
 
 
308 aa  46.6  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  28.4 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  26.61 
 
 
276 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  33.8 
 
 
715 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  33.8 
 
 
715 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  28.42 
 
 
268 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  29.89 
 
 
350 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  32.26 
 
 
515 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3393  transglutaminase-like  30.63 
 
 
559 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  29.89 
 
 
484 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  31.15 
 
 
485 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  27.2 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0731  transglutaminase-like  40.74 
 
 
281 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.149665  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0341  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
453 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.896818 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  42.59 
 
 
268 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  33.8 
 
 
739 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  27.05 
 
 
631 aa  43.9  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  26.98 
 
 
273 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  33.8 
 
 
739 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  33.8 
 
 
734 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  33.8 
 
 
734 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  32.39 
 
 
730 aa  43.5  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  35.29 
 
 
273 aa  43.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  27.22 
 
 
259 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  37.5 
 
 
311 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>