More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1556 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1556  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  548  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  31.06 
 
 		 343 aa  102  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  40.91 
 
 		 391 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  40.15 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  33.33 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  40.17 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  30.6 
 
 		 744 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3647  transglutaminase domain protein  30.08 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  27.78 
 
 		 815 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  32.8 
 
 		 743 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  31.3 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  29.47 
 
 		 681 aa  66.2  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  34.23 
 
 		 806 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3755  hypothetical protein  32.56 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  26.37 
 
 		 485 aa  62  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  25.93 
 
 		 730 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  27.1 
 
 		 890 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  28.93 
 
 		 1305 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 		 792 aa  59.7  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30.4 
 
 		 827 aa  59.3  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  25.85 
 
 		 571 aa  58.9  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  26.38 
 
 		 677 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  30.37 
 
 		 720 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  31.58 
 
 		 794 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  25.47 
 
 		 762 aa  55.8  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  23.72 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  29.09 
 
 		 862 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  25.16 
 
 		 653 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  30.53 
 
 		 795 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  24.83 
 
 		 763 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  29.67 
 
 		 748 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0068  transglutaminase domain protein  28.45 
 
 		 373 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0531153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  34.55 
 
 		 742 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  28.24 
 
 		 730 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0169  hypothetical protein  33.33 
 
 		 629 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  25.42 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  31.94 
 
 		 672 aa  52.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  28.57 
 
 		 742 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  26.85 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  31.4 
 
 		 742 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3008  transglutaminase-like  29.36 
 
 		 321 aa  52.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  31.4 
 
 		 742 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  33.77 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  24.64 
 
 		 645 aa  52.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  31.4 
 
 		 742 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  27.54 
 
 		 300 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  31.4 
 
 		 742 aa  52  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  31.4 
 
 		 742 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  28.57 
 
 		 742 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  30.53 
 
 		 637 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  28.35 
 
 		 822 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  29.13 
 
 		 815 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  32.88 
 
 		 680 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  19.86 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  31.9 
 
 		 635 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  31.08 
 
 		 774 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  21.66 
 
 		 674 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  32.29 
 
 		 728 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  25.21 
 
 		 810 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  29.73 
 
 		 748 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  31.34 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  29.41 
 
 		 790 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  27.07 
 
 		 656 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  22.63 
 
 		 668 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  33.33 
 
 		 689 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  26.19 
 
 		 800 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  25.95 
 
 		 736 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  28.18 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  30.88 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  29.17 
 
 		 332 aa  50.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4760  transglutaminase domain-containing protein  24.79 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0619763  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  30.56 
 
 		 767 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  21.23 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  25.81 
 
 		 317 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 280 aa  49.3  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  29.92 
 
 		 292 aa  49.3  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  25.93 
 
 		 763 aa  49.7  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  26.92 
 
 		 788 aa  49.3  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  32.35 
 
 		 684 aa  49.3  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0484  S-layer domain-containing protein  27.78 
 
 		 586 aa  48.9  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000124996  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  26.26 
 
 		 271 aa  48.9  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  29.25 
 
 		 303 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  36.11 
 
 		 726 aa  48.9  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  23.45 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1072  S-layer protein, putative  34.34 
 
 		 578 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.043499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0916  S-layer protein  34.34 
 
 		 577 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0018351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0884  S-layer protein  31.09 
 
 		 578 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  26.5 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1144  S-layer protein  34.34 
 
 		 578 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000385936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0981  s-layer protein  34.34 
 
 		 577 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000154114  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  31.94 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  22.14 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  30.84 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  28.3 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  29.59 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4285  S-layer domain protein  34.34 
 
 		 577 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00013823  normal  0.102971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  26.02 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1056  putative S-layer protein  34.34 
 
 		 576 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.48899e-34 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0881  S-layer domain-containing protein  32.99 
 
 		 578 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000484445  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  26.96 
 
 		 706 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>