62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1528 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1528  transglutaminase-like protein enzymes putative cysteine protease-like protein  100 
 
 
204 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2335  hypothetical protein  44.79 
 
 
204 aa  166  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0101813  normal  0.0257295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1549  putative lipoprotein  43.68 
 
 
202 aa  148  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0446  Cro-like protein  41.15 
 
 
193 aa  144  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.949753  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  42.93 
 
 
366 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1662  transglutaminase domain protein  43.37 
 
 
202 aa  138  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  42.13 
 
 
211 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0064  transglutaminase domain protein  40.53 
 
 
209 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3713  putative lipoprotein  39.15 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  39.08 
 
 
216 aa  130  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1053  putative lipoprotein  40.62 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2806  hypothetical protein  40.11 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2432  Transglutaminase-like protein protein-like protein  40.11 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00531924  hitchhiker  0.00000220472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2764  Transglutaminase-like protein protein-like protein  40.11 
 
 
215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.184871 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3168  hypothetical protein  40.11 
 
 
215 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2007  hypothetical protein  41.14 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1674  conserved hypothetical protein-putative cysteine protease  41.14 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1729  putative lipoprotein  44.38 
 
 
172 aa  119  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2281  putative lipoprotein  39.89 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3320  transglutaminase domain protein  35.23 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0724375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3801  transglutaminase domain protein  38.37 
 
 
200 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1055  hypothetical protein  34.38 
 
 
200 aa  112  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446766  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3571  transglutaminase domain protein  38.74 
 
 
203 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  33.6 
 
 
280 aa  55.1  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10806  hypothetical protein  26.53 
 
 
242 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00547466  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  26 
 
 
204 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  31.58 
 
 
276 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  30.84 
 
 
298 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  28.1 
 
 
343 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  30.15 
 
 
279 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1556  transglutaminase domain-containing protein  22.14 
 
 
272 aa  49.3  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  31.93 
 
 
500 aa  48.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  29.37 
 
 
273 aa  48.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  26.79 
 
 
284 aa  48.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  28.97 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  26.02 
 
 
288 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1999  transglutaminase domain protein  32.22 
 
 
234 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  26.61 
 
 
281 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  34.57 
 
 
279 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  34.57 
 
 
279 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  38.46 
 
 
283 aa  45.4  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1117  transglutaminase domain-containing protein  33.78 
 
 
328 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.113705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  31.37 
 
 
244 aa  45.1  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  35.8 
 
 
294 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  29.29 
 
 
225 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  25.58 
 
 
398 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  35.05 
 
 
235 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  27.35 
 
 
391 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  27.35 
 
 
391 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  28.18 
 
 
291 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1654  hypothetical protein  43.33 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  33.77 
 
 
295 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3647  transglutaminase domain protein  24.22 
 
 
292 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  28.17 
 
 
571 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  28.41 
 
 
292 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  29.58 
 
 
226 aa  42  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  24.04 
 
 
316 aa  42  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2737  transglutaminase domain-containing protein  27.27 
 
 
292 aa  41.6  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215869  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  35 
 
 
276 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  26.63 
 
 
436 aa  41.2  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0784  transglutaminase domain protein  29.59 
 
 
525 aa  41.2  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>