More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2558 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2614  transglutaminase domain-containing protein  57.21 
 
 		 1107 aa  1207    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.95635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1621  transglutaminase domain-containing protein  59.89 
 
 		 1091 aa  1246    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0187167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4758  transglutaminase domain-containing protein  56.69 
 
 		 1125 aa  1200    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446948  normal  0.0794526 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1496  transglutaminase domain protein  64.58 
 
 		 1188 aa  685    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4926  transglutaminase-like superfamily domain protein  62.81 
 
 		 1092 aa  1374    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3645  transglutaminase domain protein  57.57 
 
 		 1108 aa  1280    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1778  transglutaminase domain-containing protein  60.37 
 
 		 1140 aa  1365    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.527948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3415  transglutaminase domain-containing protein  58.63 
 
 		 1116 aa  1268    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0588  transglutaminase-like  63.08 
 
 		 1092 aa  1379    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.332727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04320  transglutaminase domain protein  60.41 
 
 		 1118 aa  1339    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2359  transglutaminase domain-containing protein  53.69 
 
 		 1108 aa  1070    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3010  transglutaminase-like  60.05 
 
 		 1117 aa  1381    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.424161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0067  transglutaminase-like  59.08 
 
 		 1147 aa  1338    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2605  transglutaminase domain-containing protein  60.53 
 
 		 1174 aa  707    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1218  transglutaminase domain-containing protein  56.54 
 
 		 1135 aa  1326    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.695465  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3512  transglutaminase domain protein  55.14 
 
 		 1141 aa  1266    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2055  transglutaminase-like superfamily protein  60.19 
 
 		 1140 aa  1365    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5075  transglutaminase domain-containing protein  60.18 
 
 		 1080 aa  1280    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.804608  normal  0.120829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0541  transglutaminase-like  63.81 
 
 		 1091 aa  1386    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.649463  normal  0.642878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5370  transglutaminase domain protein  60.07 
 
 		 1081 aa  1282    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3017  transglutaminase domain-containing protein  56.67 
 
 		 1127 aa  1211    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0756013  normal  0.525776 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0954  transglutaminase-like domain-containing protein  57.3 
 
 		 1173 aa  1226    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.722165  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4406  transglutaminase domain protein  57.32 
 
 		 1157 aa  1300    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0210  transglutaminase domain protein  58.91 
 
 		 1122 aa  1273    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1933  transglutaminase-like  60.04 
 
 		 1142 aa  1379    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2553  transglutaminase-like superfamily protein  59.07 
 
 		 1169 aa  694    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12586  hypothetical protein  51.79 
 
 		 1140 aa  1064    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.265908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3334  transglutaminase domain protein  52.77 
 
 		 1139 aa  1123    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387126  normal  0.0234354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3405  transglutaminase domain protein  61.9 
 
 		 1180 aa  683    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2558  transglutaminase-like  100 
 
 		 1090 aa  2203    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.884999  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0857  transglutaminase domain protein  57.54 
 
 		 1112 aa  1244    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250645  normal  0.314962 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4489  transglutaminase domain-containing protein  57.57 
 
 		 1142 aa  1314    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1919  transglutaminase domain-containing protein  67.26 
 
 		 1145 aa  697    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2470  transglutaminase domain-containing protein  60.61 
 
 		 1122 aa  1315    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1712  transglutaminase-like  58.49 
 
 		 1114 aa  1308    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.347512 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3879  transglutaminase domain protein  59.16 
 
 		 1158 aa  1313    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2315  Protein of unknown function DUF2126  51.04 
 
 		 1155 aa  1072    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3412  transglutaminase domain-containing protein  60.92 
 
 		 1137 aa  1388    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4005  transglutaminase domain-containing protein  58.88 
 
 		 1144 aa  1358    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962784  normal  0.211891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4110  transglutaminase domain-containing protein  59.45 
 
 		 1148 aa  698    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0770  transglutaminase domain-containing protein  60.37 
 
 		 1140 aa  1365    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2051  Protein of unknown function DUF2126  47.21 
 
 		 1078 aa  939    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.238647 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3099  transglutaminase-like domain-containing protein  57.41 
 
 		 1116 aa  1322    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.595628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1701  transglutaminase-like  58.57 
 
 		 1090 aa  1275    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126756  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0678  transglutaminase domain-containing protein  60.19 
 
 		 1140 aa  1362    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1065  transglutaminase domain-containing protein  59.51 
 
 		 1121 aa  1310    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.417532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3159  transglutaminase-like  58.91 
 
 		 1217 aa  694    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.668757  normal  0.863803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0725  transglutaminase family protein  58.01 
 
 		 1157 aa  1286    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3752  hypothetical protein  58.15 
 
 		 1114 aa  1275    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139209  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3608  transglutaminase domain protein  58.1 
 
 		 1104 aa  1252    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  0.238952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3585  transglutaminase-like  59.4 
 
 		 1128 aa  1323    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.222679  normal  0.726735 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1309  Protein of unknown function DUF2126  58.08 
 
 		 1100 aa  1286    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.544002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2947  hypothetical protein  58.86 
 
 		 1103 aa  1283    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0655  transglutaminase domain-containing protein  62.74 
 
 		 1097 aa  1350    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.559922  hitchhiker  0.000135984 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2524  transglutaminase domain protein  57.09 
 
 		 1120 aa  1254    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3724  transglutaminase domain protein  58.72 
 
 		 1116 aa  1269    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.565418  normal  0.0894015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0988  transglutaminase domain-containing protein  54.84 
 
 		 1119 aa  1268    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4255  transglutaminase-like  60.83 
 
 		 1137 aa  1386    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253349  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2320  transglutaminase-like protein  53.6 
 
 		 1108 aa  1069    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0950324  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4275  transglutaminase domain protein  59.35 
 
 		 1113 aa  1305    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0684346  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1063  transglutaminase domain-containing protein  60.37 
 
 		 1140 aa  1365    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1392  transglutaminase-like enzyme, cysteine protease  54.14 
 
 		 1151 aa  1243    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.284441  normal  0.67203 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3522  transglutaminase domain-containing protein  58.36 
 
 		 1149 aa  1351    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0515  transglutaminase domain-containing protein  58.82 
 
 		 1136 aa  1264    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2637  transglutaminase domain-containing protein  59.63 
 
 		 1091 aa  1271    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0330314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4111  transglutaminase domain-containing protein  60.83 
 
 		 1137 aa  1386    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3343  transglutaminase domain protein  57.57 
 
 		 1108 aa  1276    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0393  transglutaminase domain-containing protein  55.58 
 
 		 1114 aa  1253    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2038  transglutaminase domain-containing protein  60.37 
 
 		 1140 aa  1365    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.654776  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2907  transglutaminase-like domain protein  57.09 
 
 		 1120 aa  1254    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2367  transglutaminase domain-containing protein  53.6 
 
 		 1108 aa  1069    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.021822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1014  transglutaminase domain protein  59.82 
 
 		 1128 aa  1322    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2628  transglutaminase domain-containing protein  53.23 
 
 		 1112 aa  1078    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0769  transglutaminase domain-containing protein  60.19 
 
 		 1140 aa  1365    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106544  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3771  transglutaminase domain-containing protein  52.41 
 
 		 1133 aa  1080    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510583  normal  0.20356 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3033  transglutaminase domain-containing protein  59.04 
 
 		 1100 aa  1319    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2246  transglutaminase domain protein  58.89 
 
 		 1145 aa  631  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.637206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1477  hypothetical protein  39.32 
 
 		 731 aa  477  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.288638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4657  transglutaminase domain protein  52.43 
 
 		 289 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0892  transglutaminase domain protein  45.99 
 
 		 277 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5163  transglutaminase domain protein  43.86 
 
 		 279 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4490  transglutaminase domain protein  37.76 
 
 		 296 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4426  transglutaminase domain protein  37.76 
 
 		 296 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2052  Protein of unknown function DUF2126  34.3 
 
 		 697 aa  187  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.598866 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1034  transglutaminase-like  35.59 
 
 		 287 aa  168  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1611  transglutaminase domain protein  36.1 
 
 		 305 aa  160  9e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  37.63 
 
 		 276 aa  158  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0273  transglutaminase domain-containing protein  34.93 
 
 		 328 aa  154  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.260289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3591  transglutaminase domain protein  33.78 
 
 		 291 aa  151  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1984  transglutaminase-like  35.32 
 
 		 291 aa  146  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  36.06 
 
 		 313 aa  146  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2984  transglutaminase domain protein  34.26 
 
 		 302 aa  145  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4766  transglutaminase domain protein  32.73 
 
 		 290 aa  141  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5097  hypothetical protein  32.53 
 
 		 297 aa  140  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1847  transglutaminase-like  35.4 
 
 		 300 aa  139  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1814  transglutaminase domain protein  36.1 
 
 		 302 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.853279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5604  transglutaminase domain-containing protein  33.7 
 
 		 309 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.639349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2753  transglutaminase-like  35.23 
 
 		 288 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1061  transglutaminase domain-containing protein  32.49 
 
 		 314 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1555  transglutaminase domain-containing protein  35.29 
 
 		 290 aa  132  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>