128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1704 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1704  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 423 aa  882    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0326146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2077  transglutaminase domain protein  27.65 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2471  transglutaminase domain-containing protein  25.35 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.534692  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02467  conserved hypothetical protein  27.53 
 
 		 696 aa  63.2  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0484  S-layer domain-containing protein  30.77 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000124996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  29.32 
 
 		 631 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0881  S-layer domain-containing protein  36.63 
 
 		 578 aa  56.6  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000484445  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  34.95 
 
 		 266 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1144  S-layer protein  29.38 
 
 		 578 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000385936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0916  S-layer protein  31.25 
 
 		 577 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0018351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0900  S-layer protein  32.82 
 
 		 578 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000625317  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0981  s-layer protein  31.25 
 
 		 577 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000154114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1019  putative S-layer protein  32.06 
 
 		 577 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0271963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4285  S-layer domain protein  32.06 
 
 		 577 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00013823  normal  0.102971 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1056  putative S-layer protein  30.56 
 
 		 576 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.48899e-34 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1858  transglutaminase domain-containing protein  28.67 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000428903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1072  S-layer protein, putative  30.56 
 
 		 578 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.043499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0884  S-layer protein  30.56 
 
 		 578 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  31.25 
 
 		 272 aa  54.3  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  26.9 
 
 		 280 aa  54.3  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  32.38 
 
 		 343 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  27.56 
 
 		 649 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  31.82 
 
 		 264 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1807  murein endopeptidase  30.23 
 
 		 386 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0843  putative lipoprotein  31.07 
 
 		 744 aa  53.9  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.277994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  32.89 
 
 		 276 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  43.08 
 
 		 266 aa  53.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1823  murein endopeptidase  29.46 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.57805e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  34.34 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1509  transglutaminase domain-containing protein  32.32 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000210837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  35.11 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1997  putative protease  26.74 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000694194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2073  protease, putative  34.34 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000121211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2028  putative protease  32.32 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2092  putative protease  31.68 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3332  putative protease  32.32 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000192317  unclonable  3.65908e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  36.36 
 
 		 515 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  35.44 
 
 		 313 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  45.76 
 
 		 271 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1852  protease  31.31 
 
 		 386 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000203248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1995  protease  31.31 
 
 		 386 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000762612  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  39.19 
 
 		 266 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 285 aa  51.2  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  29.66 
 
 		 391 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  29.66 
 
 		 391 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22960  Transglutaminase-like superfamily protein  25.93 
 
 		 424 aa  50.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000122213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0514  putative lipoprotein  31.63 
 
 		 756 aa  50.1  0.00008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.492219  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  33.67 
 
 		 299 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  34.25 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0731  transglutaminase-like  33.7 
 
 		 281 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.149665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  34.62 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  37.08 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  27.86 
 
 		 492 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  34.94 
 
 		 273 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  29.59 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  26.13 
 
 		 265 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  34.62 
 
 		 259 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0068  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0531153  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  28.78 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0513  putative lipoprotein  29.47 
 
 		 747 aa  48.1  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  36.11 
 
 		 292 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  27.56 
 
 		 284 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  36.23 
 
 		 281 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 272 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  36.14 
 
 		 326 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  30.3 
 
 		 276 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  34.02 
 
 		 316 aa  47  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  30.53 
 
 		 323 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  41.51 
 
 		 268 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  30.3 
 
 		 276 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0169  hypothetical protein  24.83 
 
 		 629 aa  47  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08210  SH3 domain protein (Cyk3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03400)  23.87 
 
 		 1789 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  31.17 
 
 		 273 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0607  putative lipoprotein  30.85 
 
 		 818 aa  46.2  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.256534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  30.11 
 
 		 274 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  28.47 
 
 		 943 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 266 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  33.77 
 
 		 281 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 265 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  36.9 
 
 		 293 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  31.17 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  27.59 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  36.62 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0166  transglutaminase domain protein  37.68 
 
 		 308 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0772661  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  29.31 
 
 		 279 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  29.9 
 
 		 294 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  35.71 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  32.22 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  27.12 
 
 		 286 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  28.06 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  36.47 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  25.64 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  31.73 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15691  transglutaminase-like superfamily protein  32.22 
 
 		 281 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798972  normal  0.306347 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  26.5 
 
 		 274 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  34.04 
 
 		 673 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  24.52 
 
 		 685 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  34.25 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  26.55 
 
 		 286 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>