39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03940 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_03940  Transglutaminase-like superfamily protein  100 
 
 
346 aa  721    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.474674  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0169  hypothetical protein  35.79 
 
 
629 aa  99.4  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0484  S-layer domain-containing protein  35.14 
 
 
586 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000124996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  34.68 
 
 
1710 aa  96.7  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1856  transglutaminase domain-containing protein  32 
 
 
363 aa  96.7  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0548672  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22380  hypothetical protein  29.44 
 
 
397 aa  90.9  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1858  transglutaminase domain-containing protein  31.35 
 
 
386 aa  89.7  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000428903  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1509  transglutaminase domain-containing protein  34.32 
 
 
386 aa  89.4  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000210837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0881  S-layer domain-containing protein  34.22 
 
 
578 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000484445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1144  S-layer protein  33.16 
 
 
578 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000385936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0884  S-layer protein  33.16 
 
 
578 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1056  putative S-layer protein  33.16 
 
 
576 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.48899e-34 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1072  S-layer protein, putative  33.16 
 
 
578 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.043499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0981  s-layer protein  32.62 
 
 
577 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000154114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0900  S-layer protein  32.62 
 
 
578 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000625317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0916  S-layer protein  32.62 
 
 
577 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0018351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2028  putative protease  29.19 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4285  S-layer domain protein  32.62 
 
 
577 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00013823  normal  0.102971 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1019  putative S-layer protein  32.62 
 
 
577 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0271963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2092  putative protease  30 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3332  putative protease  30 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000192317  unclonable  3.65908e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1807  murein endopeptidase  29.19 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1995  protease  28.65 
 
 
386 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000762612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1852  protease  28.65 
 
 
386 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000203248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2073  protease, putative  28.65 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000121211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1823  murein endopeptidase  28.65 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.57805e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  27.6 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1997  putative protease  30.86 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000694194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2123  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 
773 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.034622  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0513  putative lipoprotein  37.25 
 
 
747 aa  68.9  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114455  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0514  putative lipoprotein  37.5 
 
 
756 aa  64.3  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.492219  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22960  Transglutaminase-like superfamily protein  23.74 
 
 
424 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000122213  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0607  putative lipoprotein  31.13 
 
 
818 aa  63.9  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.256534  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0758  putative lipoprotein  37.31 
 
 
718 aa  62  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0843  putative lipoprotein  35.63 
 
 
744 aa  59.7  0.00000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.277994  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1491  hypothetical protein  28.99 
 
 
530 aa  57  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00542195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2077  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2471  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.534692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1704  transglutaminase domain protein  26.71 
 
 
423 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0326146  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>