48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2123 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2123  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
773 aa  1573    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.034622  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1856  transglutaminase domain-containing protein  37.13 
 
 
363 aa  98.2  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0548672  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03940  Transglutaminase-like superfamily protein  26.35 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.474674  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0484  S-layer domain-containing protein  32.88 
 
 
586 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000124996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  28.16 
 
 
1710 aa  73.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1858  transglutaminase domain-containing protein  29.66 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000428903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1997  putative protease  28.28 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000694194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3332  putative protease  28.28 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000192317  unclonable  3.65908e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1509  transglutaminase domain-containing protein  27.5 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000210837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4285  S-layer domain protein  31.03 
 
 
577 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00013823  normal  0.102971 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1019  putative S-layer protein  31.03 
 
 
577 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0271963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1807  murein endopeptidase  27.59 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2028  putative protease  27.59 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1823  murein endopeptidase  27.59 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.57805e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2073  protease, putative  27.59 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000121211  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0513  putative lipoprotein  33.59 
 
 
747 aa  67.4  0.0000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1144  S-layer protein  30.34 
 
 
578 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000385936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2092  putative protease  27.59 
 
 
386 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1995  protease  26.9 
 
 
386 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000762612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1072  S-layer protein, putative  30.34 
 
 
578 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.043499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0884  S-layer protein  30.34 
 
 
578 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1852  protease  26.9 
 
 
386 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000203248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0900  S-layer protein  30.34 
 
 
578 aa  65.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000625317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1056  putative S-layer protein  30.34 
 
 
576 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.48899e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0916  S-layer protein  30.34 
 
 
577 aa  65.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0018351  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0981  s-layer protein  30.34 
 
 
577 aa  65.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000154114  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0758  putative lipoprotein  33.06 
 
 
718 aa  64.7  0.000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0881  S-layer domain-containing protein  30.34 
 
 
578 aa  64.7  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000484445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0169  hypothetical protein  28.1 
 
 
629 aa  62  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0514  putative lipoprotein  31.09 
 
 
756 aa  57.4  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.492219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  30.3 
 
 
466 aa  57  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22960  Transglutaminase-like superfamily protein  25.68 
 
 
424 aa  55.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000122213  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22380  hypothetical protein  28.86 
 
 
397 aa  53.5  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0607  putative lipoprotein  31.82 
 
 
818 aa  53.5  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.256534  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1491  hypothetical protein  32.56 
 
 
530 aa  51.6  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00542195  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0843  putative lipoprotein  36.99 
 
 
744 aa  50.8  0.00008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.277994  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02467  conserved hypothetical protein  30.47 
 
 
696 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2471  transglutaminase domain-containing protein  31.25 
 
 
326 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.534692  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  37.93 
 
 
391 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  37.93 
 
 
391 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  24.84 
 
 
280 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  35.21 
 
 
515 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  31.46 
 
 
668 aa  45.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2077  transglutaminase domain protein  23.44 
 
 
317 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  33.82 
 
 
656 aa  44.7  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  34.15 
 
 
715 aa  44.3  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  34.15 
 
 
715 aa  44.3  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  34.15 
 
 
715 aa  44.3  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>