41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0755 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0755  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  100 
 
 		 344 aa  678    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2342  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.87 
 
 		 350 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0487  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.4 
 
 		 455 aa  212  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2888  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.46 
 
 		 356 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.057915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2490  hypothetical protein  37.43 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1713  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.26 
 
 		 454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  40.41 
 
 		 1164 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  34.72 
 
 		 899 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  37.14 
 
 		 801 aa  66.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1016  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 880 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  31.16 
 
 		 1672 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.6 
 
 		 915 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  38.36 
 
 		 752 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1190  glycoside hydrolase family protein  34.93 
 
 		 807 aa  56.6  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112997  normal  0.725074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2557  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.36 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.13 
 
 		 1448 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  38.38 
 
 		 609 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1083  glycoside hydrolase family protein  36.05 
 
 		 807 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148049 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0169  hypothetical protein  39.58 
 
 		 629 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  30.2 
 
 		 1127 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  31.03 
 
 		 732 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  32.89 
 
 		 1332 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  33.1 
 
 		 879 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  27.33 
 
 		 2117 aa  49.3  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  33.86 
 
 		 588 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  36.55 
 
 		 578 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  31.55 
 
 		 1059 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  30.41 
 
 		 1070 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1085  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.92 
 
 		 669 aa  47  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.26 
 
 		 756 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.77 
 
 		 729 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.77 
 
 		 953 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  35.42 
 
 		 850 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.17 
 
 		 1007 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  34.38 
 
 		 571 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  29.45 
 
 		 1103 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.11 
 
 		 1060 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  32.67 
 
 		 999 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  29.13 
 
 		 392 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  31.58 
 
 		 1471 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4999  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  33.33 
 
 		 834 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.517089  normal  0.335211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>