38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1190 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1190  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 807 aa  1623    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112997  normal  0.725074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4999  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  71.8 
 
 		 834 aa  1177    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.517089  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1083  glycoside hydrolase family protein  97.52 
 
 		 807 aa  1559    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148049 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  35.84 
 
 		 1127 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  39.41 
 
 		 1135 aa  488  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0280  glycosy hydrolase family protein  38.87 
 
 		 740 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1714  glycoside hydrolase family protein  36.07 
 
 		 951 aa  405  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  36.83 
 
 		 927 aa  398  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1016  glycoside hydrolase family protein  31.77 
 
 		 880 aa  333  6e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0126  glycoside hydrolase family protein  30.97 
 
 		 586 aa  233  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0534718  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0300  glycoside hydrolase family protein  31.6 
 
 		 592 aa  206  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  46.21 
 
 		 899 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1713  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  45.52 
 
 		 454 aa  112  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 1164 aa  91.3  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  35.33 
 
 		 752 aa  65.1  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0487  coagulation factor 5/8 type domain protein  35 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  35.71 
 
 		 999 aa  58.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  35.83 
 
 		 637 aa  58.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0755  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.93 
 
 		 344 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00219053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.17 
 
 		 578 aa  53.9  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  33.78 
 
 		 1200 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.5 
 
 		 1007 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.52 
 
 		 755 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  34.48 
 
 		 433 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.33 
 
 		 581 aa  50.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.48 
 
 		 1212 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.89 
 
 		 819 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.5 
 
 		 962 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.18 
 
 		 915 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.48 
 
 		 933 aa  47.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  30.61 
 
 		 850 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.03 
 
 		 756 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.77 
 
 		 674 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.55 
 
 		 953 aa  45.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2888  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 		 356 aa  44.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.057915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  31.62 
 
 		 1070 aa  44.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.51 
 
 		 1362 aa  44.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  30.19 
 
 		 1471 aa  44.7  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>