68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1713 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1713  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  100 
 
 		 454 aa  932    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  40.2 
 
 		 483 aa  199  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  40.66 
 
 		 615 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  55.94 
 
 		 1164 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5733  S1D (lysyl endopeptidase) subfamily C-terminal domain protein  35 
 
 		 349 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1190  glycoside hydrolase family protein  47.13 
 
 		 807 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112997  normal  0.725074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0755  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.26 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  44.67 
 
 		 899 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1083  glycoside hydrolase family protein  41.05 
 
 		 807 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2342  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.54 
 
 		 350 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1016  glycoside hydrolase family protein  43.57 
 
 		 880 aa  113  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4999  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  40.82 
 
 		 834 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.517089  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  42.11 
 
 		 1127 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  43.8 
 
 		 1135 aa  94  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2888  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.09 
 
 		 356 aa  93.6  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.057915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0487  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.62 
 
 		 455 aa  93.2  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  36.29 
 
 		 927 aa  77.8  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  34.78 
 
 		 1059 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1714  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 		 951 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  28.85 
 
 		 801 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  36.07 
 
 		 571 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  36.08 
 
 		 1471 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.27 
 
 		 915 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  32.9 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  35.37 
 
 		 752 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.25 
 
 		 1158 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  26.55 
 
 		 578 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  30.92 
 
 		 999 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  31.69 
 
 		 1070 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.66 
 
 		 674 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  34.75 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  35 
 
 		 1581 aa  57.4  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.2 
 
 		 756 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.25 
 
 		 1007 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  32.14 
 
 		 850 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.13 
 
 		 755 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  34.23 
 
 		 449 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2490  hypothetical protein  31.51 
 
 		 448 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  30 
 
 		 452 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.35 
 
 		 1109 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  30.07 
 
 		 1332 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.62 
 
 		 815 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  36.36 
 
 		 2117 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.71 
 
 		 933 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.79 
 
 		 962 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  33.57 
 
 		 987 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.65 
 
 		 1117 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.77 
 
 		 929 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.87 
 
 		 1448 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.4 
 
 		 1564 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.61 
 
 		 639 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1085  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.65 
 
 		 669 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185669  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2555  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.04 
 
 		 736 aa  47.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  27.93 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  28.47 
 
 		 644 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.1 
 
 		 953 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  28.75 
 
 		 732 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  31.2 
 
 		 637 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  28.67 
 
 		 1441 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.89 
 
 		 1212 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  27.66 
 
 		 879 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2557  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.37 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.02 
 
 		 695 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  27.21 
 
 		 722 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.33 
 
 		 795 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.7 
 
 		 722 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  27.86 
 
 		 1028 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 1184 aa  43.5  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>