122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1605 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 1212 aa  2370    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  58.7 
 
 		 1109 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.8 
 
 		 823 aa  429  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  38.67 
 
 		 671 aa  379  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  40.37 
 
 		 675 aa  366  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.51 
 
 		 795 aa  320  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  38.74 
 
 		 1000 aa  310  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.3 
 
 		 1410 aa  298  6e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  37.02 
 
 		 1091 aa  292  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1213 aa  275  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  61.04 
 
 		 1001 aa  275  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  43.85 
 
 		 1200 aa  250  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.51 
 
 		 584 aa  216  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.27 
 
 		 1448 aa  214  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  30.03 
 
 		 1418 aa  213  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  29.75 
 
 		 1085 aa  195  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  60.14 
 
 		 933 aa  175  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  34.26 
 
 		 1736 aa  160  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  52.36 
 
 		 1193 aa  158  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3784  Glycoprotein endo-alpha-1,2-mannosidase  54.35 
 
 		 510 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00391126  normal  0.836971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  28.71 
 
 		 981 aa  139  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  37.56 
 
 		 607 aa  111  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3309  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.58 
 
 		 208 aa  105  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1802 aa  94.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  37.98 
 
 		 756 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0172  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.85 
 
 		 685 aa  89  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.238557  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  30.26 
 
 		 1626 aa  85.1  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  34.27 
 
 		 1073 aa  84.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  38.68 
 
 		 772 aa  80.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  35.92 
 
 		 897 aa  78.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  44.66 
 
 		 1424 aa  77.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  42.99 
 
 		 1428 aa  76.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  44.55 
 
 		 662 aa  74.7  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  37.7 
 
 		 616 aa  73.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  49.11 
 
 		 608 aa  72  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.2 
 
 		 726 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.57 
 
 		 1321 aa  69.3  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  26.51 
 
 		 2239 aa  65.9  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  34.08 
 
 		 663 aa  64.3  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  30.05 
 
 		 1029 aa  63.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.69 
 
 		 929 aa  63.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.6 
 
 		 755 aa  63.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  35.83 
 
 		 1303 aa  61.6  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  28.06 
 
 		 2690 aa  61.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.41 
 
 		 815 aa  61.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  41.18 
 
 		 2169 aa  59.7  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.31 
 
 		 756 aa  59.7  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  25.37 
 
 		 1070 aa  58.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.68 
 
 		 962 aa  57.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.31 
 
 		 1007 aa  57.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  34.62 
 
 		 433 aa  57.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  40 
 
 		 657 aa  55.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  30.87 
 
 		 571 aa  55.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  31.94 
 
 		 1164 aa  54.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.07 
 
 		 1158 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.39 
 
 		 953 aa  53.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  31.13 
 
 		 637 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 		 1362 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.13 
 
 		 674 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 		 915 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1311  putative lipoprotein  37.25 
 
 		 420 aa  53.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1320  putative lipoprotein  37.25 
 
 		 420 aa  53.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  32.61 
 
 		 392 aa  53.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1808  putative lipoprotein  37.25 
 
 		 420 aa  52.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00934071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1151  putative lipoprotein  37.25 
 
 		 421 aa  52.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.403494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0716  putative lipoprotein  37.25 
 
 		 421 aa  52.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0434  putative lipoprotein  37.25 
 
 		 421 aa  52.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.19 
 
 		 1117 aa  52.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.15 
 
 		 940 aa  52.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1083  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 807 aa  52  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148049 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1457  putative lipoprotein  36.27 
 
 		 419 aa  51.6  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  33.06 
 
 		 879 aa  51.6  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  33.9 
 
 		 452 aa  51.6  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.85 
 
 		 639 aa  51.6  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0792  hypothetical protein  34.06 
 
 		 431 aa  50.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.992362  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  37 
 
 		 699 aa  50.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  31.65 
 
 		 1103 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  32.03 
 
 		 1192 aa  51.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  24.77 
 
 		 801 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 2082 aa  50.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1190  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 		 807 aa  50.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112997  normal  0.725074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  36.21 
 
 		 987 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.33 
 
 		 1564 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  30.28 
 
 		 999 aa  50.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.56 
 
 		 1967 aa  50.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  31.69 
 
 		 752 aa  50.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  33.94 
 
 		 685 aa  49.7  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  36.67 
 
 		 850 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.33 
 
 		 578 aa  49.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2429  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.96 
 
 		 372 aa  49.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3641  hypothetical protein  31.02 
 
 		 332 aa  49.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  33.79 
 
 		 1310 aa  49.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2293  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.96 
 
 		 372 aa  48.9  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3599  hypothetical protein  39.64 
 
 		 694 aa  48.5  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161985  decreased coverage  0.00880556 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  30.61 
 
 		 818 aa  48.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  32.56 
 
 		 644 aa  48.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  34.86 
 
 		 2002 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  33.33 
 
 		 1035 aa  48.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  31.98 
 
 		 2207 aa  48.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.01 
 
 		 984 aa  48.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>