31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2429 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2293  parallel beta-helix repeat-containing protein  97.58 
 
 		 372 aa  707    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2429  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 372 aa  722    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0792  hypothetical protein  72.39 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.992362  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3715  parallel beta-helix repeat-containing protein  68.45 
 
 		 563 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1457  putative lipoprotein  62.26 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0434  putative lipoprotein  61.99 
 
 		 421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1151  putative lipoprotein  61.99 
 
 		 421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.403494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0716  putative lipoprotein  61.99 
 
 		 421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1320  putative lipoprotein  61.99 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1808  putative lipoprotein  61.99 
 
 		 420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00934071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1311  putative lipoprotein  61.73 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4400  hypothetical protein  56.3 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0913462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4103  hypothetical protein  56.68 
 
 		 424 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1813  hypothetical protein  60.95 
 
 		 429 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3628  hypothetical protein  56.4 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1348  hypothetical protein  42.92 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1329  hypothetical protein  42.86 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1312  hypothetical protein  42.86 
 
 		 359 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  27.73 
 
 		 807 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1082  putative lipoprotein  40.2 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.91 
 
 		 1410 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  28.87 
 
 		 671 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1718  hypothetical protein  30.96 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.586514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  27.63 
 
 		 675 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1213 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  25.88 
 
 		 1085 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.96 
 
 		 1212 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  27.19 
 
 		 1000 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.81 
 
 		 1109 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  23.89 
 
 		 1418 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.29 
 
 		 584 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>