64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5731 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  100 
 
 
1073 aa  2029    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  35.78 
 
 
1434 aa  172  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.52 
 
 
11716 aa  154  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  42.86 
 
 
772 aa  150  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  33.21 
 
 
702 aa  145  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  32.54 
 
 
503 aa  130  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  33.47 
 
 
640 aa  125  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  31.67 
 
 
1736 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  30.8 
 
 
1437 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  36.94 
 
 
1827 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  31.69 
 
 
1346 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  26.81 
 
 
811 aa  112  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  28.34 
 
 
1433 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  28.5 
 
 
2064 aa  110  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  31.1 
 
 
621 aa  109  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  35.13 
 
 
937 aa  101  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  33.17 
 
 
935 aa  99  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  35.69 
 
 
897 aa  97.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  30.3 
 
 
706 aa  96.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  34.24 
 
 
1029 aa  97.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  27.12 
 
 
1348 aa  95.1  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  27.22 
 
 
1337 aa  92.4  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  28.39 
 
 
819 aa  92.4  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.58 
 
 
2507 aa  89.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  28.22 
 
 
749 aa  87.8  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.27 
 
 
1212 aa  83.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  34.09 
 
 
885 aa  82.8  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  27.27 
 
 
752 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  26.43 
 
 
2239 aa  72.8  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  29.12 
 
 
756 aa  69.3  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.05 
 
 
726 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  30.14 
 
 
607 aa  68.6  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  28.4 
 
 
1802 aa  67.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  30.91 
 
 
2117 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  29.38 
 
 
1313 aa  65.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  26.96 
 
 
1626 aa  63.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  44.76 
 
 
699 aa  63.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1258  hypothetical protein  32.45 
 
 
561 aa  60.1  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
1428 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  33.33 
 
 
1321 aa  58.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  29.06 
 
 
2886 aa  58.5  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  39.22 
 
 
616 aa  58.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  29.52 
 
 
2082 aa  57.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  32.11 
 
 
608 aa  57.4  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  27.45 
 
 
1193 aa  57  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  26.11 
 
 
2690 aa  55.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  33.04 
 
 
1303 aa  54.3  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  36.36 
 
 
644 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.61 
 
 
1001 aa  53.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2225  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  39.53 
 
 
490 aa  52.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  37.18 
 
 
1035 aa  51.6  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.39 
 
 
1109 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  34.21 
 
 
586 aa  50.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  36.96 
 
 
2002 aa  50.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  26.82 
 
 
2207 aa  49.7  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  52.46 
 
 
663 aa  49.7  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  25.47 
 
 
1192 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  27.92 
 
 
2169 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  36.73 
 
 
657 aa  47.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  36.54 
 
 
1310 aa  47  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0341  hypothetical protein  31.46 
 
 
427 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156991  hitchhiker  0.00506023 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  32.95 
 
 
812 aa  46.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  39.81 
 
 
662 aa  45.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  36.29 
 
 
767 aa  44.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>