42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0767 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  100 
 
 		 811 aa  1622    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  64.43 
 
 		 819 aa  1014    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  34.63 
 
 		 1434 aa  245  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.46 
 
 		 11716 aa  238  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  29.42 
 
 		 2064 aa  237  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  34.44 
 
 		 702 aa  229  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  32.4 
 
 		 621 aa  206  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  36.82 
 
 		 640 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  28.54 
 
 		 706 aa  144  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  32.79 
 
 		 1827 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.9 
 
 		 2507 aa  122  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  27.91 
 
 		 1348 aa  114  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.24 
 
 		 1073 aa  107  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  31.05 
 
 		 1337 aa  107  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  28.69 
 
 		 1437 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  27.52 
 
 		 1346 aa  95.9  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  27.62 
 
 		 1433 aa  94.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  28.19 
 
 		 752 aa  91.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  27.65 
 
 		 935 aa  89.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  27.1 
 
 		 749 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  30.74 
 
 		 1243 aa  78.2  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  28.03 
 
 		 885 aa  68.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  29.39 
 
 		 503 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  36.36 
 
 		 2820 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  26.43 
 
 		 937 aa  57.8  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  34.71 
 
 		 2853 aa  55.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  25.18 
 
 		 406 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  25.37 
 
 		 402 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  22.6 
 
 		 506 aa  51.6  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.71 
 
 		 1340 aa  50.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.55 
 
 		 1154 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  25.28 
 
 		 690 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.27 
 
 		 1222 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2569  FG-GAP repeat protein  28.77 
 
 		 685 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.1 
 
 		 1118 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.94 
 
 		 1225 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  28.08 
 
 		 1129 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  25.43 
 
 		 1022 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.2 
 
 		 8871 aa  45.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.4 
 
 		 1139 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.06 
 
 		 1490 aa  44.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  25.59 
 
 		 912 aa  44.3  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>