54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2870 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  100 
 
 		 1243 aa  2376    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  42.31 
 
 		 1980 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  56.38 
 
 		 2262 aa  239  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1969 aa  189  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  33.58 
 
 		 1288 aa  108  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  57.14 
 
 		 2207 aa  108  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  29.78 
 
 		 1987 aa  99.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1303 aa  98.2  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  27.65 
 
 		 4429 aa  92.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  28.39 
 
 		 2278 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  31.24 
 
 		 1748 aa  83.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  31 
 
 		 1976 aa  80.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  30.9 
 
 		 1108 aa  77.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1547 aa  77.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  32.32 
 
 		 2416 aa  76.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  30.74 
 
 		 811 aa  77  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  30.14 
 
 		 1657 aa  75.5  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  28.89 
 
 		 2421 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  35 
 
 		 2796 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  37.5 
 
 		 4044 aa  64.3  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  31.18 
 
 		 2064 aa  63.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  28.21 
 
 		 2270 aa  62.4  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35.4 
 
 		 1130 aa  61.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  30.23 
 
 		 819 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  26.37 
 
 		 2233 aa  60.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  34.81 
 
 		 1527 aa  59.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  38.18 
 
 		 2487 aa  58.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  27.56 
 
 		 2239 aa  57  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  33.11 
 
 		 1160 aa  57  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  29.97 
 
 		 1463 aa  56.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  31.54 
 
 		 3958 aa  56.2  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  30.04 
 
 		 1634 aa  55.1  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  25.92 
 
 		 2344 aa  55.1  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  26.66 
 
 		 3563 aa  54.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  25.94 
 
 		 1483 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  26.24 
 
 		 3562 aa  53.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  33.85 
 
 		 3089 aa  52.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  26.75 
 
 		 627 aa  52  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  26.39 
 
 		 991 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1245 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  33.33 
 
 		 887 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.08 
 
 		 3977 aa  49.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  33.88 
 
 		 2411 aa  49.3  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.44 
 
 		 1292 aa  49.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  28.79 
 
 		 3793 aa  48.9  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3244  Immunoglobulin I-set domain protein  30.67 
 
 		 532 aa  48.5  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000478897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  26.28 
 
 		 3333 aa  48.5  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  32.23 
 
 		 874 aa  47.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  28.61 
 
 		 1266 aa  46.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  27.83 
 
 		 976 aa  45.8  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  26.2 
 
 		 4071 aa  45.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  34.03 
 
 		 14944 aa  45.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  26.39 
 
 		 3542 aa  45.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2366  Htaa domain protein  32.68 
 
 		 1127 aa  45.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527032  normal  0.0458127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>