106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4229 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 1527 aa  3127    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  29.95 
 
 		 1079 aa  145  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1976 aa  100  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  32.5 
 
 		 2411 aa  94  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  32.5 
 
 		 2367 aa  93.6  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1210 aa  75.1  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  27.7 
 
 		 953 aa  71.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  29.47 
 
 		 2807 aa  70.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.35 
 
 		 1222 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.69 
 
 		 1225 aa  69.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.2 
 
 		 1019 aa  67.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  26.08 
 
 		 1838 aa  68.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  25.65 
 
 		 1275 aa  68.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.61 
 
 		 1113 aa  67.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.11 
 
 		 1118 aa  67  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  24.41 
 
 		 2772 aa  66.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  28.77 
 
 		 2454 aa  65.9  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  27.17 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  28.77 
 
 		 2421 aa  65.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.69 
 
 		 1340 aa  65.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.32 
 
 		 2194 aa  63.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.52 
 
 		 889 aa  61.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  33.94 
 
 		 2262 aa  61.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  28.41 
 
 		 8871 aa  60.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 335 aa  60.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  34.56 
 
 		 1243 aa  59.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  25.53 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.76 
 
 		 1490 aa  58.9  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  26.75 
 
 		 897 aa  58.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.33 
 
 		 859 aa  58.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  26.69 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  29.86 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  35.47 
 
 		 1695 aa  57.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1969 aa  57.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.55 
 
 		 1394 aa  55.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  31.09 
 
 		 872 aa  55.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2057  FG-GAP repeat-containing protein  32.19 
 
 		 282 aa  54.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  42.47 
 
 		 1095 aa  54.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  26.91 
 
 		 974 aa  54.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  27.07 
 
 		 1223 aa  54.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1684  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  27.45 
 
 		 363 aa  53.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00411006  hitchhiker  0.00000638895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.67 
 
 		 1246 aa  52.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3077  hypothetical protein  22.85 
 
 		 673 aa  52.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  24.5 
 
 		 3542 aa  52.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  24.56 
 
 		 760 aa  52  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 344 aa  52  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 336 aa  52  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  23.93 
 
 		 1288 aa  51.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  24.14 
 
 		 976 aa  51.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 336 aa  51.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 336 aa  51.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  27.24 
 
 		 386 aa  51.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0369  hypothetical protein  27.78 
 
 		 333 aa  51.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.415147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 		 1127 aa  51.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  25.19 
 
 		 1126 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  31.58 
 
 		 1245 aa  50.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  25.82 
 
 		 750 aa  50.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  28.5 
 
 		 681 aa  50.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 338 aa  50.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  26.39 
 
 		 319 aa  50.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  26.85 
 
 		 324 aa  50.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  34 
 
 		 2042 aa  50.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1785  FG-GAP repeat protein  24.05 
 
 		 413 aa  50.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  25.93 
 
 		 616 aa  50.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 338 aa  49.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  25.69 
 
 		 346 aa  49.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  27.45 
 
 		 342 aa  50.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5752  lipase class 3  30.52 
 
 		 512 aa  50.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0300845  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  26.59 
 
 		 341 aa  49.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.56 
 
 		 2807 aa  49.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.41 
 
 		 342 aa  49.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.2 
 
 		 1009 aa  49.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  27.34 
 
 		 404 aa  48.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  29.25 
 
 		 338 aa  48.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  41.51 
 
 		 2207 aa  48.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 332 aa  48.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  26.61 
 
 		 338 aa  48.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 337 aa  48.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 338 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  25.74 
 
 		 510 aa  48.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  21.24 
 
 		 742 aa  48.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  26.24 
 
 		 402 aa  48.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  37.37 
 
 		 1081 aa  47.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 336 aa  47.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  26.79 
 
 		 343 aa  47.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  26.29 
 
 		 517 aa  47.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  25.13 
 
 		 336 aa  46.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  47.76 
 
 		 757 aa  47  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 338 aa  46.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.79 
 
 		 645 aa  46.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  25.81 
 
 		 338 aa  46.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  22.16 
 
 		 329 aa  46.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  23.97 
 
 		 2528 aa  46.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0370  hypothetical protein  28.15 
 
 		 392 aa  46.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.940465  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  37.31 
 
 		 1070 aa  46.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  26.21 
 
 		 329 aa  46.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  32.61 
 
 		 561 aa  46.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  27.94 
 
 		 472 aa  45.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  30.17 
 
 		 649 aa  45.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  25 
 
 		 649 aa  45.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>