Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | Cpin_0549 |
Symbol | |
ID | 8356655 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Chitinophaga pinensis DSM 2588 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_013132 |
Strand | - |
Start bp | 654353 |
End bp | 667642 |
Gene Length | 13290 bp |
Protein Length | 4429 aa |
Translation table | 11 |
GC content | 51% |
IMG OID | 644962695 |
Product | Fibronectin type III domain protein |
Protein accession | YP_003120248 |
Protein GI | 256419595 |
COG category | |
COG ID | |
TIGRFAM ID | |
| 

|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 0 |
Plasmid unclonability p-value | 1 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | 32 |
Fosmid unclonability p-value | 1 |
Fosmid Hitchhiker | No |
Fosmid clonability | normal |
| |
Sequence |
Gene sequence | ATGCATTTCA AAGCTACTCC TAAAAGCCCG TTAAGAGCTT TTATTCTTAT TTTCTTTTGC CTGGTCTGGC TGGTTGGGTT ACCGGTGGGT AAGGCTTCCT ATAAGAAGCT CCCCGTAACT AAAGCCGTCC CCAAAGATGG CGCAATCTCC AGGTTGGACA ATTACCTATT GCATCACCCC TATGCACCAT TACTACCAAA TGCCTGGCGT AATGCCGGCG CTGCCGATGG GCCACTATGG AGCTACGCCG GCAGTCAGTC CTTTGTCACC TTCGGCCTTG CCTGTGCATT GTGTCGTGTT GACGATGGGG CTAATGCCAT TGACGCCAAT CCCAATACTG CCGCTACACT CGTACTACCG GTAGGCGCTG CAGGAGGGGT TGGATTAAAG CTAAAGTTCA GTGGTAGTTA TCAGGCTGGT GACCAGGTGG CCTTCGACCT GGAAATACCT GACCAGATCT ACTCCCAGCA GTTACTTTCC GCACTTTCTG TGACCTCCTT TAATGGAGGC GTATCTAATA ATGACGCTAC CCCGCTGAAT AGTTCCCAGA TCCGCCTCGA CCTCTTAGGT CTCGGTCTTG GTTCTACGCC GAAATTTCGC GTAACAGCTC CTGTCACGCA TGCTTTTGAT GAAGTACAGA TCAGTTTATC AACGCTGGTC AGCACCTTTA CTTCTCTGCG TGTATATGAA GCTGCCGCAT TTATTCCTGT AACAGTAAGT CCTGCGAATC CTGCTATCAC TTCCAATGCT ACTGTTACCT TCTCTCCTTC TATCAGAATT CCTAACGCCA CCTATTCATG GTATACCACC CCCGAAGGTG GTACGCCCGT GTTTAATGGC GCCGGATTTA CCACGCCTCC GCTGAAACGC AGTACTACTT ATTACGTGGC 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