39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0768 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  64.43 
 
 		 811 aa  1034    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  100 
 
 		 819 aa  1638    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  36.63 
 
 		 1434 aa  253  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.48 
 
 		 11716 aa  243  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  33.85 
 
 		 702 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  30.08 
 
 		 2064 aa  231  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  33.33 
 
 		 621 aa  221  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  34.9 
 
 		 640 aa  196  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  29.94 
 
 		 706 aa  157  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.22 
 
 		 2507 aa  128  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  30.22 
 
 		 1827 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  28.96 
 
 		 1346 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  30.35 
 
 		 935 aa  108  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  29.12 
 
 		 1348 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  27.78 
 
 		 1433 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.76 
 
 		 1073 aa  92.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  27.25 
 
 		 1437 aa  91.3  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  27.51 
 
 		 1337 aa  90.9  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  28.22 
 
 		 752 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  26.72 
 
 		 749 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  27.95 
 
 		 885 aa  77.8  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  26.78 
 
 		 937 aa  66.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  27.67 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  37.4 
 
 		 2820 aa  62.4  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1243 aa  61.6  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  36.59 
 
 		 2853 aa  60.1  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.67 
 
 		 1340 aa  51.2  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  28.25 
 
 		 912 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0074  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.13 
 
 		 1133 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659099  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.54 
 
 		 1222 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.67 
 
 		 8871 aa  47.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.43 
 
 		 1118 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  25.82 
 
 		 2911 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.05 
 
 		 1225 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  26.9 
 
 		 690 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  25.49 
 
 		 3204 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  28.1 
 
 		 974 aa  45.8  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.97 
 
 		 1154 aa  45.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  37.5 
 
 		 501 aa  44.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>