130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4051 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  100 
 
 
2262 aa  4378    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  44.64 
 
 
2402 aa  555  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  48.1 
 
 
3089 aa  446  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  31.29 
 
 
1804 aa  323  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  31.38 
 
 
6497 aa  301  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  36.38 
 
 
1064 aa  248  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  29.46 
 
 
5298 aa  239  6e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  60.77 
 
 
1243 aa  238  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  28.42 
 
 
1463 aa  229  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  34.12 
 
 
561 aa  223  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  32.98 
 
 
1969 aa  204  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  28.76 
 
 
2713 aa  194  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  30.13 
 
 
874 aa  191  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  33.75 
 
 
759 aa  186  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  26.27 
 
 
5544 aa  183  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  30.98 
 
 
1547 aa  166  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  29.52 
 
 
2270 aa  157  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  27.84 
 
 
3793 aa  144  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  25.74 
 
 
3958 aa  132  6e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  27.02 
 
 
3794 aa  122  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  58.49 
 
 
2207 aa  110  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  32.99 
 
 
885 aa  107  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  27.76 
 
 
890 aa  102  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  33.69 
 
 
1266 aa  100  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  34.58 
 
 
532 aa  99.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  28.71 
 
 
1483 aa  99.4  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  27.42 
 
 
1287 aa  95.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  29.96 
 
 
994 aa  93.6  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  29.86 
 
 
534 aa  93.2  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  23.79 
 
 
4044 aa  92.8  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.65 
 
 
1679 aa  92.4  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  33.1 
 
 
1976 aa  92  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  29.68 
 
 
1657 aa  89.7  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  31.65 
 
 
1108 aa  87  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  28.9 
 
 
535 aa  87  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  30.84 
 
 
2239 aa  85.9  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  29.22 
 
 
540 aa  85.9  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  38.64 
 
 
2487 aa  85.1  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  34.79 
 
 
991 aa  85.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  26.69 
 
 
503 aa  83.2  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  38.82 
 
 
815 aa  79.7  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  36.22 
 
 
1288 aa  79  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  31.95 
 
 
1247 aa  76.3  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  25.73 
 
 
1139 aa  75.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1676  hypothetical protein  26.53 
 
 
1460 aa  74.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  26.99 
 
 
1345 aa  75.1  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  27.37 
 
 
1163 aa  72.8  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  28.42 
 
 
1222 aa  72.8  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.19 
 
 
1130 aa  70.5  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  33.43 
 
 
1002 aa  69.3  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  28.77 
 
 
1879 aa  69.3  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  26.79 
 
 
1771 aa  68.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  32.46 
 
 
1585 aa  67.4  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  35.82 
 
 
1634 aa  67  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  33.33 
 
 
652 aa  66.6  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  30.61 
 
 
1488 aa  65.9  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  35.38 
 
 
2042 aa  64.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  25.54 
 
 
2454 aa  65.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  24.13 
 
 
1193 aa  64.3  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33430  Ig-like domain-containing protein  27.36 
 
 
3230 aa  63.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  23.18 
 
 
1607 aa  63.2  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  25 
 
 
1140 aa  62  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  33.51 
 
 
1439 aa  62  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  33.94 
 
 
1527 aa  61.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  26.48 
 
 
989 aa  61.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  24.82 
 
 
938 aa  60.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  23.85 
 
 
1068 aa  60.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  29.77 
 
 
2367 aa  60.1  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  26.15 
 
 
2807 aa  60.1  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  31.55 
 
 
1217 aa  59.7  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  29.77 
 
 
2411 aa  59.7  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  33.33 
 
 
14944 aa  59.7  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1018  thermopsin  25.67 
 
 
952 aa  58.9  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0978818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3244  Immunoglobulin I-set domain protein  27.97 
 
 
532 aa  58.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000478897  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  31.28 
 
 
2796 aa  57.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2366  Htaa domain protein  28.2 
 
 
1127 aa  57.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527032  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6116  hypothetical protein  41.86 
 
 
555 aa  57.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.751728  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  21.51 
 
 
967 aa  57.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2555  hypothetical protein  28.87 
 
 
1310 aa  57  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942961  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  31.82 
 
 
523 aa  56.6  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.09 
 
 
1015 aa  56.6  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  27.91 
 
 
2418 aa  55.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  27.92 
 
 
2421 aa  55.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  37.32 
 
 
1668 aa  55.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  26.15 
 
 
662 aa  55.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  24.96 
 
 
1313 aa  53.9  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  32.08 
 
 
1474 aa  54.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  35.98 
 
 
3563 aa  54.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  29.74 
 
 
1466 aa  53.9  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  27.19 
 
 
953 aa  53.9  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  25.3 
 
 
2345 aa  53.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  28.01 
 
 
3333 aa  53.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  30.16 
 
 
627 aa  53.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  30.49 
 
 
1695 aa  52  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  36.16 
 
 
1748 aa  52  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  30.49 
 
 
1160 aa  52  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  28.1 
 
 
1222 aa  52  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  28.22 
 
 
1079 aa  51.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  34.43 
 
 
774 aa  51.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  31.46 
 
 
1672 aa  50.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>