87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1677 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  100 
 
 		 2233 aa  4344    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  52.69 
 
 		 3474 aa  389  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  45.22 
 
 		 3699 aa  280  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.5 
 
 		 3699 aa  276  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  45.29 
 
 		 2839 aa  261  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  37.13 
 
 		 3544 aa  226  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  44.84 
 
 		 2503 aa  218  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  36.13 
 
 		 2522 aa  204  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  43.82 
 
 		 2476 aa  195  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  38.53 
 
 		 2853 aa  175  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  32.95 
 
 		 4231 aa  159  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  39.03 
 
 		 2820 aa  157  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  37.23 
 
 		 3598 aa  154  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  36.42 
 
 		 3089 aa  149  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  41.78 
 
 		 2715 aa  146  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  29.41 
 
 		 4465 aa  143  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1902 aa  134  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  29.78 
 
 		 1359 aa  132  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  33.13 
 
 		 2001 aa  128  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  32.13 
 
 		 1779 aa  126  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  29.63 
 
 		 2886 aa  117  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  29.56 
 
 		 1699 aa  116  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.25 
 
 		 11716 aa  113  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  29.96 
 
 		 2194 aa  112  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.33 
 
 		 4480 aa  105  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  37.08 
 
 		 5020 aa  100  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  30.99 
 
 		 2074 aa  98.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  33.11 
 
 		 2153 aa  94.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  35.58 
 
 		 2701 aa  85.1  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  34.8 
 
 		 2132 aa  84.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  34.6 
 
 		 731 aa  83.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  43.75 
 
 		 873 aa  82.8  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  30.4 
 
 		 3477 aa  82  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.35 
 
 		 2507 aa  80.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.78 
 
 		 994 aa  80.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  31.85 
 
 		 1002 aa  76.3  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  39.73 
 
 		 3227 aa  73.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  26.72 
 
 		 2079 aa  67.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  28.57 
 
 		 2636 aa  64.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  32.06 
 
 		 1631 aa  64.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  29.73 
 
 		 3864 aa  63.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  39.73 
 
 		 852 aa  62.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  28.86 
 
 		 3066 aa  62.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  36.32 
 
 		 1597 aa  59.3  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  36.17 
 
 		 715 aa  58.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  34.01 
 
 		 954 aa  58.2  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  24.87 
 
 		 3244 aa  58.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  27.09 
 
 		 2402 aa  57.4  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.81 
 
 		 2156 aa  57.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3285  Outer membrane autotransporter barrel  36.09 
 
 		 1895 aa  57  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.761058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  31.31 
 
 		 781 aa  56.6  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  35 
 
 		 4022 aa  54.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  33.33 
 
 		 1421 aa  54.7  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.52 
 
 		 1806 aa  53.5  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  28.52 
 
 		 4830 aa  53.9  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  27.29 
 
 		 5442 aa  53.9  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  27.52 
 
 		 2031 aa  53.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.52 
 
 		 1825 aa  53.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1588  Outer membrane autotransporter barrel  33.33 
 
 		 1184 aa  53.5  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.52 
 
 		 1825 aa  53.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  32.61 
 
 		 2353 aa  53.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  28.81 
 
 		 1238 aa  52.8  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.26 
 
 		 369 aa  52.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.52 
 
 		 2031 aa  52.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  27.52 
 
 		 2031 aa  52.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  29.11 
 
 		 768 aa  52  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.52 
 
 		 850 aa  51.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.17 
 
 		 2032 aa  51.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  29.31 
 
 		 1867 aa  51.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  30.38 
 
 		 3927 aa  50.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  32.59 
 
 		 2182 aa  50.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.32 
 
 		 1092 aa  50.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  34.88 
 
 		 1129 aa  50.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  27.37 
 
 		 8321 aa  49.7  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  32.42 
 
 		 7284 aa  49.7  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  29.39 
 
 		 2767 aa  49.3  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.69 
 
 		 5745 aa  48.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  31.33 
 
 		 2954 aa  48.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  29.44 
 
 		 819 aa  48.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  25.78 
 
 		 962 aa  48.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  22.77 
 
 		 3563 aa  47.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  27.64 
 
 		 2656 aa  47.8  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  26.02 
 
 		 1728 aa  47  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0929  Ig family protein  29.73 
 
 		 1025 aa  47  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  34.75 
 
 		 1092 aa  46.2  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  28.72 
 
 		 4848 aa  45.8  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  30.05 
 
 		 7434 aa  45.8  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>