102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04140 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  100 
 
 
887 aa  1813    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04145  metalloprotease, putative  41.19 
 
 
935 aa  636    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.18498  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  40.98 
 
 
927 aa  614  9.999999999999999e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  36.55 
 
 
1311 aa  274  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  36 
 
 
1393 aa  271  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  36.47 
 
 
1393 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2937  protease-associated PA  36.21 
 
 
730 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3130  peptidase M36 fungalysin  35.67 
 
 
730 aa  237  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3023  protease-associated PA domain protein  35.67 
 
 
730 aa  237  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449431  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  47.5 
 
 
839 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01650  Extracellular elastinolytic metalloproteinase precursor, putative  36.8 
 
 
831 aa  148  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.462944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2538  coagulation factor 5/8 type-like protein  34.25 
 
 
1043 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  38.75 
 
 
1053 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1810  peptidase M36, fungalysin  29.04 
 
 
1146 aa  88.6  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0492  peptidase M36 fungalysin  25.55 
 
 
1147 aa  87.4  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.921805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3266  peptidase M36 fungalysin  29.58 
 
 
1168 aa  84  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0508645  normal  0.0224871 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  46.32 
 
 
1220 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3304  protease-associated PA domain protein  42.15 
 
 
567 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  30.18 
 
 
950 aa  75.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3188  protease-associated PA  41.32 
 
 
567 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.19 
 
 
1323 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39 
 
 
728 aa  68.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  36.54 
 
 
1215 aa  64.7  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.44 
 
 
1212 aa  62.4  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  30.86 
 
 
1406 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  39.19 
 
 
669 aa  58.2  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
1332 aa  57.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  29.71 
 
 
1407 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  41.79 
 
 
1618 aa  56.6  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  29.71 
 
 
1407 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  41.33 
 
 
1407 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  39.19 
 
 
1570 aa  54.7  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  31.94 
 
 
1570 aa  54.7  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  36.36 
 
 
1042 aa  54.3  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.54 
 
 
891 aa  53.9  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  38.2 
 
 
513 aa  53.9  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45 
 
 
1212 aa  53.5  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  32.14 
 
 
548 aa  52.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3313  cold-active alkaline serine protease  29.92 
 
 
514 aa  52.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.15 
 
 
1212 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  34.21 
 
 
1093 aa  52  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2248  hypothetical protein  23.91 
 
 
549 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.15 
 
 
1212 aa  51.6  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03245  hypothetical protein  33.33 
 
 
406 aa  51.6  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  37.31 
 
 
812 aa  51.2  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2242  neutral metalloprotease, putative  26.67 
 
 
503 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.848329  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  42.19 
 
 
1570 aa  50.4  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1978  bacillolysin  26.67 
 
 
503 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2324  putative neutral metalloprotease  26.67 
 
 
503 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000332319  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  33.33 
 
 
1243 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  30.11 
 
 
500 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48084  predicted protein  26.61 
 
 
538 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0292036  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  26.37 
 
 
655 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2028  neutral metalloprotease  26 
 
 
503 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1996  bacillolysin  26 
 
 
503 aa  49.3  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2183  neutral metalloprotease  26 
 
 
503 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17749  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  32.77 
 
 
1300 aa  49.7  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2413  cold-active alkaline serine protease  36 
 
 
526 aa  49.7  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.07 
 
 
1283 aa  49.3  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.31 
 
 
1160 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2189  putative neutral metalloprotease  26.5 
 
 
503 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2202  putative neutral metalloprotease  26 
 
 
503 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000414955 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16187  predicted protein  29.07 
 
 
501 aa  48.9  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3130  putative neutral metalloprotease  26.5 
 
 
503 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0709705  normal  0.0367114 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03265  hypothetical protein  30.34 
 
 
528 aa  48.9  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0507671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  24.59 
 
 
1449 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  31.11 
 
 
1031 aa  48.9  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  28.89 
 
 
774 aa  48.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  32.61 
 
 
560 aa  47.8  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4627  serine protease  28.66 
 
 
702 aa  47.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2017  peptidase  26.24 
 
 
503 aa  47.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0329262  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3777  hypothetical protein  32.53 
 
 
1163 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.65 
 
 
1776 aa  47  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  27.01 
 
 
861 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  27.55 
 
 
391 aa  46.6  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  31.91 
 
 
512 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2100  immunoreactive 63 kDa antigen PG102  28.42 
 
 
554 aa  45.8  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.586482 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01380  peptidase, putative  29.79 
 
 
950 aa  46.2  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1118  predicted protein  32.65 
 
 
595 aa  46.2  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  31.76 
 
 
874 aa  46.2  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  33.75 
 
 
639 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  31.76 
 
 
365 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  23.38 
 
 
827 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  28.36 
 
 
998 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  25 
 
 
502 aa  45.8  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2720  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.39 
 
 
613 aa  45.8  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000639683  hitchhiker  0.000730662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  29 
 
 
510 aa  45.8  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1621  peptidase  26.13 
 
 
502 aa  45.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.379555  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42953  predicted protein  25.23 
 
 
557 aa  45.8  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.677298  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  25.97 
 
 
1656 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  32.89 
 
 
789 aa  45.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1876  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.39 
 
 
607 aa  45.4  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04410  hypothetical protein  27.96 
 
 
501 aa  45.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  29.79 
 
 
588 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  29.79 
 
 
595 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  32.56 
 
 
981 aa  45.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  43.33 
 
 
1035 aa  44.7  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  28.95 
 
 
562 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  31.17 
 
 
749 aa  45.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1073  hypothetical protein  30.12 
 
 
568 aa  44.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>