16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2100 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2100  immunoreactive 63 kDa antigen PG102  100 
 
 
554 aa  1150    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.586482 
 
 
-
 
NC_002950  PG2102  immunoreactive 61 kDa antigen PG91  45.42 
 
 
540 aa  445  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1798  immunoreactive 46 kDa antigen PG99  32.47 
 
 
405 aa  51.2  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0804  hypothetical protein  29.11 
 
 
946 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.771937  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  29.76 
 
 
1243 aa  47.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_002950  PG1427  thiol protease/hemagglutinin PrtT precursor, putative  31.88 
 
 
843 aa  47.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.491886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  32.93 
 
 
469 aa  47.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  28.57 
 
 
2239 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  30.19 
 
 
998 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  28.42 
 
 
887 aa  45.8  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1969  hypothetical protein  37.68 
 
 
300 aa  45.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.643947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  23.94 
 
 
392 aa  45.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  30.23 
 
 
461 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  27.48 
 
 
654 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  33.78 
 
 
927 aa  43.9  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  25.84 
 
 
365 aa  43.9  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>