More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2720 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0753  alkaline serine protease  70.53 
 
 
609 aa  834    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3431  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  83.71 
 
 
607 aa  1032    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3290  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  82.25 
 
 
608 aa  969    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000004601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0917  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  75.37 
 
 
608 aa  916    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0197096  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3290  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  77.29 
 
 
606 aa  966    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000745292  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2570  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  78.27 
 
 
521 aa  815    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2637  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  78.46 
 
 
521 aa  816    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000344019  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  76.18 
 
 
608 aa  957    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2745  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  78.65 
 
 
521 aa  819    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000278512  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1876  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  61.54 
 
 
607 aa  736    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2208  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  66.45 
 
 
605 aa  825    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00762588  normal  0.156391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2300  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  64.35 
 
 
606 aa  781    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2720  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
613 aa  1235    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000639683  hitchhiker  0.000730662 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  46.99 
 
 
789 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3313  cold-active alkaline serine protease  45.42 
 
 
514 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2413  cold-active alkaline serine protease  43.82 
 
 
526 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  37.64 
 
 
789 aa  292  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.08 
 
 
809 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  39.25 
 
 
807 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.64 
 
 
807 aa  273  7e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3162  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.38 
 
 
543 aa  270  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177636  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.05 
 
 
805 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.67 
 
 
803 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.88 
 
 
819 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.88 
 
 
819 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000775  regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertase  39.33 
 
 
677 aa  265  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.88 
 
 
819 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.88 
 
 
819 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  37.74 
 
 
794 aa  264  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.51 
 
 
823 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  37.92 
 
 
803 aa  260  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.19 
 
 
807 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.05 
 
 
805 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.26 
 
 
802 aa  257  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.21 
 
 
818 aa  257  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  43.25 
 
 
533 aa  210  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.57 
 
 
520 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46872  predicted protein  30.93 
 
 
670 aa  175  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.35 
 
 
699 aa  174  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  33.9 
 
 
399 aa  136  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1249  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.13 
 
 
431 aa  115  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48262  predicted protein  31.76 
 
 
559 aa  115  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1050  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.69 
 
 
413 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.141106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.73 
 
 
370 aa  108  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  31.33 
 
 
397 aa  107  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  31.33 
 
 
397 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  31.33 
 
 
397 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  31.33 
 
 
397 aa  106  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.41 
 
 
397 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  34.08 
 
 
298 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  30.9 
 
 
397 aa  104  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  30.9 
 
 
397 aa  104  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  30.9 
 
 
397 aa  104  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  30.9 
 
 
397 aa  104  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  30.9 
 
 
397 aa  104  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  33.63 
 
 
298 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 
500 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.67 
 
 
396 aa  101  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.36 
 
 
392 aa  100  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.1 
 
 
415 aa  99.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.48 
 
 
669 aa  98.6  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.62 
 
 
1029 aa  98.2  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0089  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.3 
 
 
368 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.94 
 
 
577 aa  94.7  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.02 
 
 
601 aa  94.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0755  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.28 
 
 
679 aa  94.4  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.312676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.73 
 
 
587 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  26.97 
 
 
1406 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1874  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  41.22 
 
 
474 aa  92.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.08 
 
 
406 aa  92  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173493  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0058  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.73 
 
 
449 aa  92  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.54 
 
 
423 aa  90.9  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.8 
 
 
639 aa  90.5  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1864  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.74 
 
 
316 aa  90.9  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1379  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 
641 aa  90.9  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863708  normal  0.0771449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.21 
 
 
589 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1096  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.21 
 
 
589 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1388  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.93 
 
 
444 aa  90.5  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.196735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.53 
 
 
407 aa  90.1  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264127  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1829  intracellular serine protease  32.28 
 
 
316 aa  90.1  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5774  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.79 
 
 
511 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0246285 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2078  intracellular serine protease  31.89 
 
 
316 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0118694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  26.69 
 
 
1407 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1859  intracellular serine protease  32.28 
 
 
316 aa  89.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.749891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.34 
 
 
452 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1813  intracellular serine protease  32.28 
 
 
316 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  26.69 
 
 
1407 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2001  intracellular serine protease  32.28 
 
 
316 aa  89.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  26.69 
 
 
1407 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.02 
 
 
639 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.97 
 
 
595 aa  89.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.36 
 
 
320 aa  89.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0298  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.36 
 
 
320 aa  89.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4085  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.67 
 
 
615 aa  88.6  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1710  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.65 
 
 
396 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2035  intracellular serine protease  32.28 
 
 
316 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2923000000000002e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2003  intracellular serine protease  32.52 
 
 
315 aa  87  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2098  intracellular serine protease  32.28 
 
 
316 aa  87  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.91 
 
 
423 aa  87  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.76 
 
 
653 aa  86.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>