62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1217 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  100 
 
 		 839 aa  1713    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01650  Extracellular elastinolytic metalloproteinase precursor, putative  31.87 
 
 		 831 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.462944  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  47.5 
 
 		 887 aa  217  7e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  40.26 
 
 		 927 aa  179  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04145  metalloprotease, putative  42.06 
 
 		 935 aa  176  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.18498  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0492  peptidase M36 fungalysin  27.94 
 
 		 1147 aa  166  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.921805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2538  coagulation factor 5/8 type-like protein  27.39 
 
 		 1043 aa  147  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2937  protease-associated PA  34.76 
 
 		 730 aa  144  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3130  peptidase M36 fungalysin  34.21 
 
 		 730 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3023  protease-associated PA domain protein  33.13 
 
 		 730 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449431  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  33.41 
 
 		 950 aa  131  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3266  peptidase M36 fungalysin  25.85 
 
 		 1168 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0508645  normal  0.0224871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1810  peptidase M36, fungalysin  30.47 
 
 		 1146 aa  117  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  28.29 
 
 		 1393 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  34.47 
 
 		 1393 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  27.25 
 
 		 1311 aa  100  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  36.84 
 
 		 4357 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 2082 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  42.11 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  44.44 
 
 		 1263 aa  64.3  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  44.05 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  40.74 
 
 		 2117 aa  59.3  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  42.86 
 
 		 2002 aa  58.9  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  45.57 
 
 		 1390 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  32.05 
 
 		 1281 aa  58.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  42.03 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  44.44 
 
 		 940 aa  57  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  43.04 
 
 		 1076 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  43.82 
 
 		 489 aa  54.7  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.72 
 
 		 257 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  50 
 
 		 864 aa  54.3  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  40.24 
 
 		 845 aa  53.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  44.93 
 
 		 331 aa  53.5  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  34.07 
 
 		 830 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  41.46 
 
 		 1027 aa  52  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  38.1 
 
 		 750 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  40.24 
 
 		 1095 aa  51.2  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 261 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.44 
 
 		 607 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  35.8 
 
 		 812 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  54.17 
 
 		 407 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  38.55 
 
 		 835 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1621  hypothetical protein  39.66 
 
 		 446 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.967511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  39.51 
 
 		 720 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  46.43 
 
 		 479 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  57.78 
 
 		 792 aa  49.7  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  28.77 
 
 		 259 aa  48.9  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  46.51 
 
 		 870 aa  47  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  37.88 
 
 		 667 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.96 
 
 		 1323 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0437  peptidase M4 thermolysin  30.3 
 
 		 1017 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00224619  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  47.62 
 
 		 687 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1503  cell wall/surface repeat protein  36.21 
 
 		 446 aa  47.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  40.74 
 
 		 2313 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.11 
 
 		 726 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  32.76 
 
 		 444 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2643  hypothetical protein  43.06 
 
 		 323 aa  45.8  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  45.16 
 
 		 1081 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1367  cell wall/surface repeat-containing protein  35.9 
 
 		 432 aa  45.4  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  45.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000614715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  31.25 
 
 		 778 aa  45.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  36.21 
 
 		 551 aa  44.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>