23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1073 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1073  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1148    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2444  hypothetical protein  34.08 
 
 		 498 aa  250  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  35 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.04 
 
 		 427 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.379716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  37.23 
 
 		 990 aa  50.4  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  32.94 
 
 		 1215 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1162 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  32.91 
 
 		 679 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  40.68 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  29.49 
 
 		 430 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6786  hypothetical protein  26.32 
 
 		 707 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_002950  PG2102  immunoreactive 61 kDa antigen PG91  28.97 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  32.08 
 
 		 380 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  30.12 
 
 		 887 aa  44.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  30 
 
 		 365 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  27.13 
 
 		 430 aa  44.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4545  hypothetical protein  29.76 
 
 		 772 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.402962  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  35.44 
 
 		 896 aa  44.3  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.67 
 
 		 448 aa  43.9  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  38.6 
 
 		 617 aa  43.9  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.47 
 
 		 379 aa  43.5  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  25.54 
 
 		 2706 aa  43.5  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  26.05 
 
 		 1452 aa  43.5  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>