52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1151 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  100 
 
 
896 aa  1845    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  53.66 
 
 
1162 aa  817    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  45.1 
 
 
679 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  38.85 
 
 
475 aa  76.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  42.5 
 
 
990 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  44.71 
 
 
554 aa  72  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  43 
 
 
516 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  40.62 
 
 
152 aa  69.7  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  32.1 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  40.82 
 
 
931 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  41.18 
 
 
520 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  45.12 
 
 
1270 aa  65.1  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  33.09 
 
 
468 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  40 
 
 
615 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  32.04 
 
 
398 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  40.24 
 
 
844 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.14 
 
 
492 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  47.22 
 
 
763 aa  61.2  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  40.24 
 
 
479 aa  61.2  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  37.5 
 
 
908 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  38.27 
 
 
797 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  35.79 
 
 
525 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  37.5 
 
 
545 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  42.86 
 
 
489 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  36.36 
 
 
668 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  41.33 
 
 
1061 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  37.97 
 
 
997 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  33.64 
 
 
741 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  37.65 
 
 
851 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3364  hypothetical protein  21.03 
 
 
565 aa  55.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.752802  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.64 
 
 
1092 aa  55.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  40 
 
 
685 aa  54.7  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  40.54 
 
 
513 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  40 
 
 
689 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  31.82 
 
 
524 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  35.42 
 
 
578 aa  53.5  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.21 
 
 
673 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1073  hypothetical protein  36.71 
 
 
568 aa  52.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  40.51 
 
 
562 aa  51.6  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  35.87 
 
 
294 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  33.7 
 
 
258 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  24.56 
 
 
669 aa  48.9  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  31.52 
 
 
748 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  36.23 
 
 
695 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  30.38 
 
 
1010 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1862  hypothetical protein  38.64 
 
 
829 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499944  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  22.93 
 
 
887 aa  45.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  31.07 
 
 
676 aa  45.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  36.92 
 
 
966 aa  45.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  29.87 
 
 
305 aa  44.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  31.62 
 
 
468 aa  44.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  32.47 
 
 
365 aa  44.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>