78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2687 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  100 
 
 
931 aa  1874    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1621  peptidase  31.81 
 
 
502 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.379555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2189  putative neutral metalloprotease  30.15 
 
 
503 aa  212  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3130  putative neutral metalloprotease  30.15 
 
 
503 aa  210  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0709705  normal  0.0367114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2242  neutral metalloprotease, putative  29.96 
 
 
503 aa  209  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.848329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2324  putative neutral metalloprotease  29.58 
 
 
503 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000332319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2017  peptidase  30.73 
 
 
503 aa  207  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0329262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2028  neutral metalloprotease  29.96 
 
 
503 aa  204  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2202  putative neutral metalloprotease  29.96 
 
 
503 aa  204  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000414955 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1996  bacillolysin  29.96 
 
 
503 aa  204  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2183  neutral metalloprotease  29.96 
 
 
503 aa  204  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1978  bacillolysin  29.58 
 
 
503 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0693  metallopeptidase domain-containing protein  33.4 
 
 
567 aa  185  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0989  metallopeptidase domain-containing protein  33.4 
 
 
567 aa  185  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.907547  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0758  metallopeptidase domain-containing protein  33.4 
 
 
567 aa  185  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1961  metallopeptidase domain-containing protein  33.4 
 
 
567 aa  185  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0488  metallopeptidase domain-containing protein  33.4 
 
 
567 aa  185  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2125  metallopeptidase domain-containing protein  33.4 
 
 
567 aa  185  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0846  metallopeptidase domain-containing protein  33.19 
 
 
567 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1851  metallopeptidase domain-containing protein  32.65 
 
 
567 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0597  propeptide, peptidase M4 and M36  31.41 
 
 
570 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5000  peptidase  32.67 
 
 
572 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475942  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4475  propeptide, peptidase M4 and M36  32.23 
 
 
572 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5066  propeptide, peptidase M4 and M36  30.77 
 
 
570 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3302  propeptide, peptidase M4 and M36  30.77 
 
 
570 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.677927  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5219  peptidase  31.79 
 
 
570 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  51.76 
 
 
990 aa  89  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  50 
 
 
554 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0073  hypothetical protein  36.13 
 
 
768 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.564783  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  50 
 
 
516 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  35.65 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  34.44 
 
 
525 aa  71.6  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  52.63 
 
 
489 aa  70.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  38.38 
 
 
695 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  38.04 
 
 
851 aa  67.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  47.5 
 
 
1270 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  45.12 
 
 
966 aa  67  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  44.44 
 
 
562 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  43.37 
 
 
287 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  39.74 
 
 
679 aa  66.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  42.68 
 
 
668 aa  65.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  37.61 
 
 
475 aa  64.3  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  40.79 
 
 
908 aa  62.4  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  47.14 
 
 
763 aa  62.4  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  42.86 
 
 
741 aa  62  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  38.96 
 
 
615 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  41.77 
 
 
844 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  41.86 
 
 
479 aa  61.6  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  40.24 
 
 
152 aa  61.2  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  38.14 
 
 
578 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  37.18 
 
 
520 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  36.59 
 
 
398 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  38.82 
 
 
468 aa  59.3  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  44.44 
 
 
513 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  43.88 
 
 
595 aa  58.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  30.89 
 
 
997 aa  58.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  41.3 
 
 
468 aa  57  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  36.59 
 
 
545 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001258  hypothetical protein  35.37 
 
 
749 aa  55.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  33.8 
 
 
430 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  40.82 
 
 
896 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.33 
 
 
492 aa  55.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  39.71 
 
 
1162 aa  54.7  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  35.44 
 
 
748 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  34.45 
 
 
294 aa  52.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05131  propeptide, peptidase  37.04 
 
 
317 aa  52  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  37.8 
 
 
1061 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.66 
 
 
1092 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  25 
 
 
546 aa  50.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3266  peptidase M36 fungalysin  28.5 
 
 
1168 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0508645  normal  0.0224871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  32.93 
 
 
797 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  29.7 
 
 
689 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  29.7 
 
 
685 aa  48.1  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  34.29 
 
 
542 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1169  Heparinase II/III family protein  37.84 
 
 
870 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  35.9 
 
 
902 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  39.39 
 
 
581 aa  44.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2081  hypothetical protein  31.71 
 
 
560 aa  44.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>