42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5000 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3302  propeptide, peptidase M4 and M36  91.78 
 
 		 570 aa  990    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.677927  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5219  peptidase  91.43 
 
 		 570 aa  990    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5000  peptidase  100 
 
 		 572 aa  1163    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1961  metallopeptidase domain-containing protein  77.23 
 
 		 567 aa  853    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0758  metallopeptidase domain-containing protein  77.58 
 
 		 567 aa  857    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0846  metallopeptidase domain-containing protein  77.41 
 
 		 567 aa  855    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0989  metallopeptidase domain-containing protein  77.23 
 
 		 567 aa  853    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.907547  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0693  metallopeptidase domain-containing protein  77.23 
 
 		 567 aa  853    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5066  propeptide, peptidase M4 and M36  91.78 
 
 		 570 aa  990    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4475  propeptide, peptidase M4 and M36  98.08 
 
 		 572 aa  1141    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1851  metallopeptidase domain-containing protein  78.28 
 
 		 567 aa  867    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0597  propeptide, peptidase M4 and M36  90.91 
 
 		 570 aa  960    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2125  metallopeptidase domain-containing protein  77.41 
 
 		 567 aa  855    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0488  metallopeptidase domain-containing protein  77.23 
 
 		 567 aa  853    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  30.32 
 
 		 931 aa  191  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2189  putative neutral metalloprotease  31.67 
 
 		 503 aa  174  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3130  putative neutral metalloprotease  32.53 
 
 		 503 aa  173  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0709705  normal  0.0367114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2017  peptidase  31.5 
 
 		 503 aa  170  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0329262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2324  putative neutral metalloprotease  32.1 
 
 		 503 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000332319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1978  bacillolysin  31.88 
 
 		 503 aa  166  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2242  neutral metalloprotease, putative  32.1 
 
 		 503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.848329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2028  neutral metalloprotease  30.68 
 
 		 503 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2183  neutral metalloprotease  30.68 
 
 		 503 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1996  bacillolysin  30.68 
 
 		 503 aa  163  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2202  putative neutral metalloprotease  30.68 
 
 		 503 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000414955 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1621  peptidase  31.15 
 
 		 502 aa  150  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.379555  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0073  hypothetical protein  34.81 
 
 		 768 aa  64.3  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.564783  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05131  propeptide, peptidase  35.42 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001258  hypothetical protein  37.4 
 
 		 749 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3266  peptidase M36 fungalysin  28.93 
 
 		 1168 aa  57  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0508645  normal  0.0224871 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  31.54 
 
 		 566 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  31.72 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  30.32 
 
 		 566 aa  48.9  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  31.72 
 
 		 566 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  30.2 
 
 		 566 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  28.76 
 
 		 566 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  28.76 
 
 		 566 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  28.76 
 
 		 566 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  28.76 
 
 		 566 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  30.34 
 
 		 566 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  28.69 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  30.19 
 
 		 839 aa  43.5  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>